Self-organizing clustering: non-hierarchical clustering for large scale DNA sequence data (バイオ情報学)
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概要
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近年、クラスタリングは長大なDNAシークエンスを分類あるいは解析するための、基本的かつ重要な方法と認識されている。われわれは、多数のかつ非常に大きなDNAシークエンスをオリゴヌクレオチド頻度にもとづき分類する、Self-Organizing Clustering(SOC)と呼ぶ方法およびプログラムを開発した。プログラムはコマンドラインプログラムパッケージとして開発され、インターネットを通してダウンロードおよび利用が可能である。プログラムのダウンロードは、http://rgp.nias.affrc.go.jp/programs/より、利用は、http://rgp.nias.affrc.go.jp/SOC/より行なえる。
- 2007-06-14
著者
-
小野寺 夏生
筑波大学大学院図書館情報メディア研究科
-
長村 吉晃
農業生物資源研究所
-
市川 裕章
農業生物資源研究所
-
中村 英光
東京大学大学院農学生命科学研究科
-
深海 薫
理化学研究所バイオリソースセンター
-
市川 裕章
生物研
-
中村 英光
農業生物資源研究所
-
市川 裕章
独立行政法人農業生物資源研究所
-
天野 晃
農業生物資源研究所:理化学研究所バイオリソースセンター:筑波大学
-
沼 寿隆
農業生物資源研究所
-
深海 薫
理化学研究所 バイオリソースセンター 情報解析技術室
-
小野寺 夏生
筑波大学
-
長村 吉晃
農業生物資源研
-
天野 晃
農業生物資源研究所, 理化学研究所 BRC
-
天野 晃
農業生物資源研
-
市川 裕章
農業生物資源研
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