熱揺らぎを考慮したドッキングシステムの開発(セッション5)
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概要
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ドッキングシミュレーションは,タンパク質が別のタンパク質やペプチドなどと結合する現象をシミュレーションするものである.しかし,既存のドッキングプログラムはいずれも生体内で揺らいでいるタンパク質を氷のように固まったものとして扱うことが多く,結合するリガンドの挙動を正しく評価することが難しい.本稿では,この問題を回避し,生体内での揺らいでいるタンパク質とリガンドの結合を求めるために,分子動力学シミュレーションとドッキングシミュレーションを組み合わせたシステムの開発手法についての提案をおこなう.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2006-12-21
著者
-
佐々木 愛美
奈良女子大学
-
城 和貴
奈良女子大学
-
高田 雅美
奈良女子大学
-
関嶋 政和
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
-
野口 保
産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター
-
城 和貴
奈良女子大学大学院人間文化研究科
-
野口 保
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
-
木村 紗知
奈良女子大学大学院人間文化研究科情報科学専攻
-
城 和貴
奈良女子大学大学院 人間文化研究科
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