Real-time PCR定量に用いるスタンダードDNAの評価
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概要
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Real-time PCR (polymerase chain reaction) 定量でスタンダードDNAとして用いるPCR増幅産物の適合性を，Real-time PCR法により作成した検量線により評価した。同じ遺伝子コピー数におけるThreshold cycle（Ct値）は，メタン生成古細菌のゲノムDNAとその16S rRNA遺伝子を増幅したPCR増幅産物で-0.7〜5.6サイクル異なった。この結果は，スタンダードDNAにPCR増幅産物を用いる場合，定量誤差が発生することを示すものである。また，検量線の傾きに基づいたPCR増幅効率（E）は，PCR増幅産物のReal-time PCR定量におけるスタンダードDNAとしての適合性を評価するには不十分であった。
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