琉球在来豚（アグー）の近交退化を緩和するための育種技術の確立（3）

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本試験ではおきなわブランド豚推進協議会が登録認定したアグー90頭について、mtDNA d-loopの1049bp領域におけるアグーの母系解析とMSマーカーを用いて核DNAの多型解析との関係について検討した結果、以下のとおりであった。1．mtDNA d-loop領域1049bpの塩基配列について多型性を検討した結果、アグーのmtDNAハプロタイプはタイプ1からタイプ5までの5つのタイプに分類された。2．mtDNA d-loop領域の塩基配列に基づき近隣結合法により系統学的に分類したOkumuraらが報告したmtDNAハプロタイプと照合すると、タイプ1およびタイプ2は東洋系タイプで、タイプ3、タイプ4およびタイプ5は西洋系タイプであった。東洋系タイプの頭数は、供試豚全頭の85.6％を占め、タイプ1とタイプ2との間には2ヵ所において塩基置換部位が認められた。3．20個のMSマーカーを用いて非加重結合法により系統学的に分類すると、アグーはグループIからグループVIIまでの7つのグループに分類される。4．mtDNAハプロタイプとMSマーカーによるグループとの関係は、タイプIはグループVIとグループVIIに属し、タイプ2は、グループII、グループIII、グループIV、グループVとグループVIIに属する。タイプ3はグループIとグループIIに属し、タイプ4またはタイプ5はそれぞれグループV、グループIに属する。以上のことから、アグーにおいてmtDNA d-loop領域の母系解析をする技術は、塩基配列をもとに各個体のハプロタイプを決定するため、他の西洋系の品種とアグーとの識別を科学的に証明することが可能であり、登録体制を強化するための1つの手段として有効であることが示唆された。
沖縄県畜産研究センターの論文
2009-07-00

琉球在来豚（アグー）の近交退化を緩和するための育種技術の確立（3）

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