サポートベクターマシンを用いた血友病Bデータベースの解析-アミノ酸置換の第IX因子活性への影響-

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概要

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血友病 B は血液凝固因子の一つである第 IX 因子の異常によって引き起こされる遺伝性疾患である.血友病 B については,患者の遺伝子異常がデータベース化され,血友病 B を分子レベルで組織的に研究することが可能である.本論文は,第 IX 因子のアミノ酸ミスセンス変異において,アミノ酸置換に伴う物理化学的パラメータ (分子体積,疎水性,極性,等電点,残基間接触エネルギー) の変化量を用いてサポートベクターマシンにより第 IX 因子の活性度を予測し,重症度を推定するものである.この結果,ロジスティック回帰分析による推定結果よりも優れた結果が得られた.また,パラメータとして過去の研究で用いられていなかったアミノ酸の残基間接触エネルギーを加えることにより,よりよい推定結果が得られることが分かった.
2011-09-08

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