最近傍多変量検定を用いたアレイCGHのゲノム異常領域同定に関する一考察(機械学習によるバイオデータマインニング,機械学習によるバイオデータマインニング,一般)
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概要
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近年,ゲノムのコピー数異常を網羅的に検出するための技術としてArray CGHと呼ばれる技術が開発され注目されている.Array CGHにより検出されたコピー数異常を用いることで,疾患の原因となっている異常を領域的に同定することが可能になる.しかし,異常領域を同定するには次元の異なるデータの統計量を比較する必要があり,更にそれらを全ての可能なゲノム領域について行なわなければならない.従って,検定の多重性やそれらの相関,更に適切な統計量を用いるなどの対処が不可欠となる.本研究では,最近傍多変量検定を用いることで,これらの問題に対処する.また,最近傍多変量検定により計算コストも低く抑えることができることを示す.
- 2009-05-18
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