部分代謝構造を用いた代謝パスウェイの比較解析
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概要
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代謝パスウェイは生物の機能に関する情報を含んでおり,近年様々な解析手法が提案されている.本研究では,代謝パスウェイ上の重要な酵素であるchoke pointや,代謝の定常状態を実現する最小の部分構造であるelementary flux modeを用い,生物にとって重要な部分代謝構造に着目した代謝パスウェイの比較解析を行う.古細菌,真正細菌,真核生物の3つのドメインに含まれる生物に対して上記手法を適用し,部分構造の比較,距離算出を行う.その後,系統樹を構築し,その結果に関して考察した.
- 2008-12-10
著者
-
大川 剛直
神戸大学大学院工学研究科情報知能学専攻
-
大川 剛直
神戸大学大学院 工学研究科
-
尾崎 知伸
大阪大学サイバーメディアセンター
-
大川 剛直
神戸大学大学院システム情報学研究科
-
尾崎 知伸
神戸大学自然科学系先端融合研究環
-
芦田 優太
神戸大学大学院工学研究科
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