SVMを用いた金属イオン結合部位予測システムの開発(セッション6)
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概要
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金属イオンの結合は,タンパク質の構造や機能の変化に大きな影響を与える.ゲノム配列がシーケンサーにより網羅的に読解されていくのに対して,タンパク質の立体構造はNMRやX線結晶解析によって解かれることから,あるゲノム配列が得られてから立体構造や金属イオン結合情報が明らかになるまでには相当の時間が要される.そこで本研究では,既知の金属イオンとタンパク質の結合情報をデータベースから抽出し,SVMによる機械学習から,タンパク質と金属イオンとの結合予測を行うシステム開発をしている.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2006-12-21
著者
-
城 和貴
奈良女子大学
-
高田 雅美
奈良女子大学
-
関嶋 政和
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
-
野口 保
産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター
-
城 和貴
奈良女子大学大学院人間文化研究科
-
野口 保
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
-
中澤 昌美
奈良女子大学大学院人間文化研究科
-
横田 恭宣
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
-
城 和貴
奈良女子大学大学院 人間文化研究科
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