アミノ酸配列研究用データベースの試作

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概要

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• There are typical three kinds of of Amino acid Sequence Databases, PDB, pdb-aa, nr-aa. Originally these databases have their own format. However, each format seems as records of data, is not effective for advanced research such as homological search for amino acid sequences of proteins, ORF prediction. Experimental construction of XML database have been under construction to these databases for the purpose of efficient usage in related area. This paper reports the characteristics and problems on these databases.

• 2002-05-18

著者

• 山本 晴彦

  Department Of Biological Sciences Faculty Of Science Kanagawa University

• 後藤 智範

  神奈川大学理学部情報科学科

• 長内 隆

  理化学研究所タンパク質構造機能研究グループ

• 山本 晴彦

  神奈川大学・理学部・生物科学科

• 猪股 優

  神奈川大学理学部

• 山本 晴彦

  Kanagawa Univ. Kanagawa Jpn

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