条件付き確率及び統計的指標を用いた発現量データからの組合せ的なタンパク質相互作用の推定
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概要
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本研究では,タンパク質や遺伝子発現量データを用いて,タンパク質間または遺伝子間の相互作用を推定するデータマイニング手法を提案する.提案手法では,発現している複数タンパク質の組合せが別のタンパク質の発現量に影響する相互作用モデルを想定し,条件付き確率を用いて,3 つのタンパク質が集まったときに初めて現れる組合せ的な相互作用が推定されるタンパク質の組合せを抽出する.提案手法を実際のタンパク質発現量データに適用し,統計的な分布に基づいて提案手法の有効性を検討する.
- 2010-06-11
著者
-
井上 悦子
和歌山大学
-
中川 優
和歌山大学
-
吉廣 卓哉
和歌山大学システム工学部
-
中川 優
和歌山大学システム工学部
-
藤木 生聖
和歌山大学大学院システム工学研究科
-
井上 悦子
和歌山大学システム工学部
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