黒毛和種肥育牛の枝肉形質バイオマーカーの探索I : 大規模プロテオーム解析情報と血統・枝肉形質情報の統合情報管理システムの構築

概要

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我々は，黒毛和種肥育牛の枝肉形質に関連するバイオマーカーの同定を目的とする大規模プロテオーム解析に特化した統合情報管理システムを構築した．この統合情報管理システムを利用することで，血統情報や枝肉形質の情報など43項目におよぶ肥育牛の生物情報とプロテオーム解析で得られる数百から数千個におよぶタンパク質スポットの発現量データを一元的に管理することができ，柔軟な検索機能を有したデータ管理・検索インタフェースを介して，様々な統計解析やデータマイニング解析に必要なデータ群を簡便に抽出することが可能になった．本稿では，本システムの概要を示すとともに，現在までに蓄積されている黒毛和種肥育牛の枝肉形質・血統データ，および腎周囲白色脂肪組織におけるタンパク質発現データを用いてシステムを稼働・実施することで，（1）種雄牛BとCの産子の枝肉重量の比較，（2）二代祖（母の父）が，種雄牛Dの産子の枝肉形質に与える影響の解析，（3）バラの厚さの高い群と低い群の間での十個のタンパク質スポットの発現量の比較（4）エネルギー生産に関わるタンパク質であるF1 ATPsynthase chain Fの発現量と枝肉形質との相関解析などの解析を行い，本システムの有効性を実証した．
社団法人日本畜産学会の論文
2008-11-25

黒毛和種肥育牛の枝肉形質バイオマーカーの探索I : 大規模プロテオーム解析情報と血統・枝肉形質情報の統合情報管理システムの構築

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