発現量データからの相関係数によるタンパク質間相互作用の推定手法
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概要
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生命現象の仕組みを理解する方法の一つとして,タンパク質の相互作用の解析が盛んに行われている.しかし,発現量データを用いた 3 つ以上のタンパク質の複合的相互作用の推定は難しく,発展が望まれる研究課題の一つとなっている.本研究では,複数タンパク質が構成するタンパク質の複合体が別のタンパク質の発現量に影響する相互作用モデルに基づいて,相関係数を用いて,3 つのタンパク質が集まったときに初めて現れる相乗的な相互作用が推定されるタンパク質の組合せを抽出する手法を提案する.提案手法を実際のタンパク質発現量データに適用し,統計的な分布に基づいて提案手法の有効性を検討する.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2010-02-25
著者
-
井上 悦子
和歌山大学
-
中川 優
和歌山大学
-
吉廣 卓哉
和歌山大学システム工学部
-
村上 翔
和歌山大学大学院システム工学研究科
-
中川 優
和歌山大学システム工学部
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井上 悦子
和歌山大学システム工学部
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