発現量データを用いた相関係数によるタンパク質の複合的な相互作用の推定
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概要
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本研究では,タンパク質の発現量データを用いて,タンパク質の複合的な相互作用を推定するデータマイニング手法を提案する.提案手法では,複数のタンパク質が複合体を作り別のタンパク質へ作用する相互作用モデルを想定し,相関係数を用いて相互作用するタンパク質の組合せを抽出する.ベイジアンネットワーク等の従来手法と比較して,サンプル数が少なくても適用可能である特徴がある.また,提案手法を実際のタンパク質発現量データに適用し有用性を評価する.
- 社団法人情報処理学会の論文
- 2009-02-26
著者
-
井上 悦子
和歌山大学
-
中川 優
和歌山大学
-
吉廣 卓哉
和歌山大学システム工学部
-
村上 翔
和歌山大学大学院システム工学研究科
-
中川 優
和歌山大学システム工学部
-
井上 悦子
和歌山大学システム工学部
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