Development of 101 novel SSR markers and construction of an SSR-based genetic linkage map in cucumber (Cucumis sativus L.)
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概要
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Cucumber (Cucumis sativus L.) is an important vegetable crop grown worldwide, but the number of available and mapped simple-sequence repeat (SSR) markers is insufficient for construction of an SSR-based genetic linkage map. To improve this situation, we developed SSR markers from SSR-enriched genomic libraries for C. sativus. We sequenced 2304 clones, and obtained 101 primer pairs which showed clear amplification and polymorphism among genotypes in either C. sativus or Cucumis melo (melon). In C. sativus, all were amplified and 91 were polymorphic among the three genotypes that we analyzed. In C. melo, 41 were polymorphic among the three genotypes that we analyzed, but 32 were not amplified. In addition to the SSRs developed in this study, we used SSRs and sequence-characterized amplified regions (SCARs) reported previously in cucumber and melon to construct the first SSR-based linkage map of cucumber. The map now comprises 120 SSRs and 6 SCARs. It contains 22 markers from previous cucumber maps and 8 linkage groups, and spans a distance of 625.7cM. The present map is the most comprehensive one in terms of the number of SSR markers and will therefore be highly useful in future cucumber genetic studies.
- 日本育種学会の論文
著者
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YOSHIOKA Yosuke
National Institute of Vegetable and Tea Science, National Agriculture and Food Research Organization
-
SUGIYAMA Mitsuhiro
National Institute of Vegetable and Tea Science, National Agriculture and Food Research Organization
-
SAKATA Yoshiteru
National Institute of Vegetable and Tea Science, National Agriculture and Food Research Organization
-
MATSUMOTO Satoru
National Institute of Vegetable and Tea Science, National Agriculture and Food Research Organization
-
Kubo Nakao
Biotechnology Research Department Kyoto Prefectural Agriculture Forestry And Fisheries Technology Ce
-
Kubo Nakao
Kyoto Prefectural Institute Of Agricultural Biotechnology
-
FUKINO Nobuko
National Institute of Vegetable and Tea Science (NIVTS)
-
坂田 好輝
農業技術研究機構野菜茶業研究所
-
Kubo Nakao
Graduate School of Agriculture, Kyoto Prefectural University, Kyoto Prefectural Institute of Agricul
-
Hirai Masashi
Graduate School of Agriculture, Kyoto Prefectural University, Kyoto Prefectural Institute of Agricul
-
Matsumoto Satoru
National Institute Of Vegetable And Tea Science National Agriculture And Food Research Organization
-
Hirai Masashi
Biotechnology Research Department Kyoto Prefectural Agriculture Forestry And Fisheries Technology Ce
-
Sakata Yoshiteru
National Institute Of Vegetable And Tea Science National Agriculture And Food Research Organization
-
Sakata Yoshiteru
National Institute Of Vegetable And Tea Science
-
Yoshioka Yosuke
National Inst. Of Vegetable And Tea Sci. National Agriculture And Food Res. Organization
-
Yoshioka Yosuke
National Institute Of Vegetable And Tea Science National Agriculture And Food Research Organization
-
Fukino Nobuko
National Institute Of Vegetable And Tea Science National Agriculture And Food Research Organization
-
Hirai Masashi
Graduate School Of Agriculture Kyoto Prefectural Univ.
-
Fukino Nobuko
National Inst. Of Vegetable And Tea Sci.
-
Sugiyama Mitsuhiro
National Institute Of Vegetable And Tea Science National Agriculture And Food Research Organization
-
Matsumoto Satoru
National Institute Of Vegetable And Tea Science
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