並列計算機上でのKyotoモデルによる興奮伝播シミュレーション(EVA-1:システム評価)
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概要
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生命科学分野での研究の発展により,生体に関する膨大の知識が蓄積されてきたが,いまだ解明されていない生命現象が多い.このような現象を解明する研究手法としてシミュレーション技術が有効である.特に心臟を構成する心筋細胞において,多数の定量的モデルが構築されるようになってきている.これらの細胞モデルを利用することにより,計算機上で心筋組織に関する細胞レベルの定量的なシミュレーション実験が行われるようになってきた.しかしながら,シミュレーション実験において要素数が増大するにつれ,計算量も増大する問題が生じる.そのため,一定時間内に計算可能な要素数に限界がある.本研究ではMPIによる並列計算を利用し,Kyotoモデルによる興奮伝播シミュレーションに対する計算時間の短縮を行った.また,実心臟の心筋細胞数に近い要素数でモデルを構成した場合,シミュレーションに必要な計算時間を予測した.
- 社団法人情報処理学会の論文
- 2008-07-30
著者
-
金澤 正憲
京都大学学術情報メディアセンター
-
松田 哲也
京都大学大学院情報学研究科医用工学分野
-
岩下 武史
京都大学学術情報メディアセンター
-
高橋 康人
京都大学大学院情報学研究科
-
天野 晃
立命館大学生命科学部
-
嶋吉 隆夫
財団法人京都高度技術研究所
-
松田 哲也
京都大学大学院情報学研究科
-
嶋吉 隆夫
三菱電機株式会社産業システム研究所
-
天野 晃
京都大学大学院情報学研究科
-
宋 仁煥
京都大学大学院情報学研究科
-
嶋吉 隆夫
京都高度技術研究所
-
高橋 康人
京都大学
-
岩下 武史
京都大学学術情報メデイアセンター
-
天野 晃
京都大
-
天野 晃
京都大学 大学院 医学研究科 細胞機能制御学
-
SHIMAYOSHI Takao
Cell/Biodynamics Simulation Project, Kyoto University
-
天野 晃
立命館大学生分科学部
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