HPC2500による興奮伝播シミュレーションにおける並列化ICCGソルバの性能評価
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概要
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本稿では, FitzHugh-Nagumo model を用いた心臓の興奮伝播シミュレーションの高速化について述べる.このような興奮伝播シミュレーションでは細胞膜内の電位のみを考慮するモノドメインモデル,細胞膜内外の電位を独立させて考えるバイドメインの2種の方法が存在するが,いずれの場合においても最終的に大規模な連立一次方程式を解くことに帰着される.今回はモノドメインモデルを用いたシミュレーションにおいて,並列化ICCG法(Incomplete Cholesky Conjugate Gradientmethod)を利用することで高速化を図る.ICCG法の並列化の阻害要因である前進・後退代入計算に対し2つの手法の有効性を検討した.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2008-03-19
著者
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