FHNモデルによる心臓の興奮伝播シミュレーションにおける線形反復解法に関する一検討
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概要
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心臓の興奮伝播シミュレーションにおいて,大規模な連立一次方程式を効率良く解くことはシミュレーションの高速化に必要不可欠な要素である.大規模疎行列を係数行列とする連立一次方程式の場合,直接解法で解くよりも反復解法を用いて解く方が効率良く解くことができる.本稿では,神経細胞の膜の興奮の伝達を表すFitz-Hugh-Nagumo (FHN)モデルを用いた心臓の興奮伝播シミュレーションにおける線形反復解法の高速化を並列計算アルゴリズムと大型計算機を用いたハイパフォーマンスコンピューティングの両面から行った.心筋の結合組織で心筋細胞ネットワークの導電率特性を表すモノドメインモデルを実装して,その細胞モデル(興奮膜モデル)にはFHNモデルを用いた.モノドメインモデルの興奮伝播方程式を,差分解法で離散化し,得られた連立一次方程式を並列化SSOR-CG法の一つであるJSOR-CG法によって並列計算機上で解いた.シミュレーション実験の結果により本手法の有効性が示された.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2006-03-20
著者
-
金澤 正憲
京都大学学術情報メディアセンター
-
岩下 武史
京都大学学術情報メディアセンター
-
岩下 武史
京都大学
-
岩下 武史
京都大学学術情報メデイアセンター
-
吉森 正
京都大学大学院情報学研究科システム科学専攻
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