16S, 23SrDNAおよびrDNAスペーサーのPCR-RFLP解析に基づくXanthomonas属pathovar間の遺伝的関係
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概要
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Xanthomonas属細菌各pathovarとStenotroPhomonas maltoPhiliaの系統関係を明らかにするために, PCRで増幅した3種類のDNA断片, 16SrDNA, 23SrDNAとrDNAスペーサー(ITS)についてそれぞれ10種類の制限酵素によるPCR-RFLP解析を行った。その結果, 供試したXanthomonas属細菌は, それぞれ16SrDNAの多型解析では7つのタイプ, 23SrDNAの多型解析では8タイプが検出された。これら2つの結果を総合すると, Xanthomonas属細菌は13種類のrDNA型に分類された。このrDNA型に基づいたクラスター解析の結果, 供試したXanthomonas属細菌はsubgroup1, 2と命名した2つのグループに類別され, さらにそのクラスターは近縁属であるStenotrophomonasとは区別された。一方, ITSに基づく多型解析では, 20のタイプが見いだされ, rDNAと同様に2つグループに類別された。また, おのおののグループに属する菌株群は, rDNAの解析に基づくものと一致した。以上の結果から, Xanthomonas属細菌は, 系統的には少なくとも2つのグループで構成されていることが示唆された。
- 日本植物病理学会の論文
- 1999-08-25
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