電荷平衡法へのatom typeの導入と新たなパラメータの算出
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概要
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分子力学法、分子動力学法によるエネルギーの計算における非結合相互作用の計算のために、各原子上の電荷を求めることは非常に重要である。このとき分子のとる配座によって電子状態は変化するため、それぞれの配座に対する電荷を計算する必要がある。配座の変化に対応し、かつ簡単に計算できる手法としてRappéらによって電荷平衡法（QEq法）が提唱されているが、QEq法およびその改良法であるQEq/PD法、MQEq法では、一つの原子に対して周囲の環境によらず一種類のパラメータを与えている。本研究ではBakowiesらによって提案されたQEq/PD法に対してatom typeの概念を導入し、原子の置かれた環境によって同種の原子に対しても別のパラメータを用いる方法を提唱する。また、Bakowiesらによってまだ決められていない硫黄、リンについてもパラメータを決定した。これにより、硫黄、リン原子を含む分子やニトロ化合物、ヘテロ原子を含んだ共役五員環を持つ分子などに対して、QEq法によって適切な電荷を与えることができる。
- 日本コンピュータ化学会の論文
- 2003-03-15
著者
-
広野 修一
北里大学薬学部
-
広野 修一
Department Of Pharmaceutical Sciences Kitasato University
-
小田 彰史
東北薬大薬:阪大蛋白研
-
小田 彰史
富山化学工業株式会社 創薬基盤研究所
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