コンピュータプログラムを用いたプライマーの設計と特異性予測
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概要
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Computer programs are regularly used to design primers for polymerase chain reaction (PCR) and to evaluate the qualities of the primers. Primer3 is a well-known program that suggests PCR primers, and Electronic-PCR (e-PCR) maps sequence-tagged sites on genome sequences. This report introduces the application of e-PCR to predict the specificity of the primers selected by Primer3 for Arabidopsis thaliana genes. Using various experimental examples, we discuss the usage of these programs, and the factors to consider for primer design and PCR optimization.
- 神奈川大学総合理学研究所の論文
- 2011-06-30
著者
-
安積 良隆
Department of Biological Sciences, Faculty of Science, Kanagawa University
-
山口 栄雄
神奈川大工
-
鈴木 温
神奈川大総理研
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