T-RFLP法による土壌生物群集の多様性解析(実験法)

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概要

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T-RFLP法による土壌生物群集の多様性解析。T-RFLP（末端断片長多型）法は、微生物の多様性解析において標準となりつつある手法である。図1に土壌生物に対して行われたfingerprint法関連の論文数の推移を示した。DGGE（変性ゲル濃度勾配）と並んで、本法が多く使用されていることがわかる。本稿では、著者らの線虫群集への応用における経験に基づいて、これから行うことを考えている方を対象に実験の流れや留意点を解説したい。なお、T-RFLP法の原理や概要については、邦文では渡邊・境のテキストABI社のテキストが参考になる。また、Thiesの総説は、網羅的に書かれており、一度目を通すことをお勧めする。
2010-04-01

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