23aGN-8 多次元レプリカ交換インターフェース(REIN)の開発 : レプリカ交換トンネリング時間の評価法(RETUNE)(23aGN 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
- 2011-08-24
著者
-
宮下 尚之
理研次世代計算P
-
杉田 有治
理化学研究所基幹研究所
-
杉田 有治
理研基幹研:jst-crest:bird
-
宮下 尚之
理化学研究所次世代計算科学研究開発プロジェクト
-
宮下 尚之
岐阜大人獣研
-
杉田 有治
理化学研究所
関連論文
- 21aEF-12 アミロイドβペプチドの生成に関するシミュレーション研究(21aEF 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 20aEF-12 混合膜における脂質分子の運動と構造(20aEF 液晶,複雑液体,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 22pEC-8 分子動力学シミュレーションでみるタンパク質の高圧構造転移と水の浸入の動的相関(22pEC 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- マルチカノニカルレプリカ交換分子動力学法による小蛋白質の折れ畳みシミュレーション (特集 拡張アンサンブル法)
- 30aPS-130 二重膜における脂質分子の運動(30aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- レプリカ交換分子動力学法の生体分子への応用
- 脂質二重膜・膜蛋白質の分子動力学計算(化学からみた物性物理)
- ぞくぞくとわかってきた膜を隔てたイオン輸送装置の構造
- S11I3 分子シミュレーションからカルシウムポンプの構造柔軟性を考える(膜蛋白質を介したエネルギー・情報変換機構を若手研究者が深
- 1P085 プロテインGのB1ドメインのC末端β-ヘアピンペプチドの天然構造を安定化する相互作用(蛋白質 C) 物生(安定性、折れたたみなど)))
- カルシウムポンプの構造と機能 (生命秩序を担う生体超分子) -- (生命秩序形成における物質移動制御)
- 3P091 カルシウムポンプと脂質二重膜の相互作用(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
- 3P084 β-ヘアピンを形成するG-peptideの水中のシミュレーションの構造解析(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
- 2P056 Beta2-microglobulinの部分ペプチドのシミュレーション : アミロイド形成の機構解明へ向けて(蛋白質 A) 構造)
- 1P105 カルシウムポンプのプロトン対抗輸送とカルシウム結合サイト付近の酸性残基のプロトン化率(膜蛋白質)
- 15pTA-10 分子動力学計算によるカルシウムポンプの熱揺らぎの解析(生物物理, 領域 12)
- 29pWE-11 カルシウムポンプの分子動力学(タンパク質・核酸・生体膜)(領域12)
- 29pWE-10 カルシウムポンプ(Ca^ATPase)のプロトン対抗輸送(タンパク質・核酸・生体膜)(領域12)
- REUSによるDNA base stackingの自由エネルギー計算
- 31aPS-82 REUS による DNA の自由エネルギー計算
- 1J1700 ペプチドの拡張アンサンブルシミュレーションによるエネルギー関数の比較(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
- 3P066SH3ドメインの変性状態の2次構造
- 3P063プロテインGのモデル溶媒中での拡張アンサンブルシミュレーション
- 23pYD-11 F_1-ATPase εサブユニットの分子動力学計算による研究(生物物理,領域12,ソフトマター物理,科学物理,生物物理)
- 拡張アンサンブル法によるタンパク質の折り畳みシミュレーション
- 27pZC-10 Potts模型系の拡張アンサンブルシミュレーション
- マルチカノニカルMD法によるNMR立体構造精密化
- 24aYC-9 カルシウムポンプの機能発現機構に関する分子動力学計算(若手奨励賞,化学物理一般(光応答・光散乱,量子系・電子状態,シミュレーション手法),領域12,ソフトマター物理,科学物理,生物物理)
- 29p-ZC-7 イオン化閾則に於けるポテンシャルの形状と量子効果
- 19aRE-8 1次元拡張パイエルスハバードモデルの光励起後のドメインダイナミクス
- 27aP-9 レプリカ交換法によるAr流体のモンテカルロシミュレーション
- カルシウムポンプの機能制御機構
- Val-Ala変異型蛋白質の安定性変化に関する理論的解析
- 3P018 膜中でのAベータペプチドの構造と膜付近のAPPフラグメントの構造(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 25pPSB-47 変性剤中でのプリオン蛋白質の変性の初動機構(ポスターセッション,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
- 28aYE-3 光誘起 I→N 相転移における N-I ドメイン壁と I-I' ソリトンの競合 : 励起強度と初期格子揺らぎ依存性
- 1P027水中のペプチド構造探索のための新拡張アンサンブル法の開発とその比較
- 1P025ヘリックス-コイル転移の拡張アンサンブル分子動力学シミュレーション
- 22aXA-10 マルチカノニカル法上レプリカ交換法の統合による新拡張アンサンブル法の開発
- 1C1115 新拡張アンサンブル法による効率的な水中のペプチド構造探索法の開発
- 3PA036 レプリカ交換法による水中のペプチドの立体構造予測
- 生体分子の構造探索の理論 : 分子シミュレーションでどこまでタンパク質のダイナミクスに迫れるか?
- 1P53 SH 3ドメインの基質認識におけるループの働き
- 26pPSB-45 構成比の異なるジアシルグリセロール混合膜におけるラメラ構造からの構造変化(26pPSB 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- QM/MM法を用いたリン酸化反応の遷移状態モデリング
- 理論計算からタンパク質の変性構造を探る
- 23aGN-8 多次元レプリカ交換インターフェース(REIN)の開発 : レプリカ交換トンネリング時間の評価法(RETUNE)(23aGN 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 23pGN-2 多次元レプリカ交換インターフェース(REIN)の開発 : アミロイド前駆体タンパク質の構造予測への応用(23pGN 領域12シンポジウム:ハイ・パフォーマンス・コンピューティング(HPC)を使った生体分子のシミュレーション:その現状と課題,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 膜タンパク質が触媒する物質輸送現象の分子メカニズム(計算化学)
- タンパク質系分子シミュレーションのための力場関数(最近の研究から)
- 疎水コアとα-ヘリックスを含む小タンパク質のフォールディングシミュレーション
- タンパク質系分子シミュレーションのための力場関数
- 27aPS-23 二成分脂質混合膜における膜の形態変化(27aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))