近似正規表現マッチングのためのシストリックアルゴリズムとそのFPGA実装(FIT推薦論文)(計算機システム)
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概要
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近似文字列照合とは,与えられた文字列(パターン)に類似する文字列をテキストから探し出すという問題である.主な応用としてはバイオインフォマティクスにおけるDNA配列の解析などがある.本論文では,パターンの記述に正規表現の部分クラスを用い,パターンに類似するすべての部分文字列をテキストから探し出す問題を近似正規表現マッチングと呼ぶ.そして,この問題を一次元シストリックアレーを用いて高速に解くハードウェアアルゴリズムを提案し,そのFPGA実装により提案アルゴリズムの有効性を示す.
- 2011-06-01
著者
-
若林 真一
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
永山 忍
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
宇丹 裕一朗
広島市立大学大学院情報科学研究科
-
永山 忍
広島市立大学大学院 情報科学研究科 情報工学専攻
-
若林 真一
広島市立大学大学院 情報科学研究科
-
永山 忍
広島市立大学大学院 情報科学研究科
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