タンパク質のフォールディング速度と構造パラメータとの相関解析
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
Folding rates of many globular proteins which exhibit two-state and non-two-state folding have been determined experimentally. Previous studies have focused on the two-state folding, and clarified that the folding rate of two-state proteins depends on the native backbone structure. Here, we performed a statistical analysis of the relationship between the folding rate and structure-based parameters of non-two-state proteins. As a result, we found that the formation rates of both the intermediate and the native state of non-two-state folding similarly depend on the native backbone structure. The comparison of non-two-state and two-state folding suggests that non-two-state folding is more general than two-state folding.
- 日本生物物理学会の論文
- 2006-05-25
著者
-
桑島 邦博
東大・院理
-
桑島 邦博
岡崎統合バイオ・戦略的方法論研究領域
-
桑島 邦博
東大院・理学系・物理
-
桑島 邦博
東京大学大学院理学系研究科
-
桑島 邦博
岡崎総合バイオ
-
鎌形 清人
東北大
-
鎌形 清人
東京大学大学院理学系研究科物理学専攻
関連論文
- 3A1145 ヤギα-ラクトアルブミン変異体の安定化機構
- 3PA070 安定化したヤギα-ラクトアルブミン変異体の解析
- 3PA041 高温分子動力学によるヤギα-ラクトアルブミンのアンフォールディングの構造変化の観察
- 1P038 シャペロニンGroELの第二のATP結合部位の固定(蛋白質(機能),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 3P026 イヌ・ミルク・リゾチームのフォールディングの解析(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
- 3PA040 時分割X線溶液散乱法によるリゾチームのフォールディング反応の研究
- スタフィロコッカル・ヌクレアーゼとその変異体の折れ畳み機構
- X線溶液散乱法によるGroELの変性と再構成の研究
- 1Q15 スタフィロコッカル・ヌクレアーゼの折れ畳みへのプロリン残基の影響
- 3SMB0 シャペロニンの作用の分子機構
- 2P068 イヌ・ミルク・リゾチームの安定性およびフォールディングにおけるカルシウムイオン濃度の効果(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
- 2P093 水素/重水素交換NMR法によるヤギα-ラクトアルブミンの天然及びモルテン・グロビュール状態の構造解析(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 1分子測定によるタンパク質の折りたたみ研究の展開
- 2P104 蛋白質の折り畳み運動を観測するための一分子測定手法の開発(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 2P094 非平衡条件下の蛋白質-分子の折りたたみ軌跡の直接観察(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 2P092 β_2-ミクログロブリンの酸変性と巻き戻り(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 1I1000 ウマβ-ラクトグロブリンの低温変性(1.蛋白質(C)物性,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
- 1L1600 GroELのアロステリック転移のX線小角散乱及び蛍光スペクトルによる研究(1.蛋白質(D)機能,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
- 3P034ヌクレオチドによるGroELの構造変化のX線小角散乱法による研究
- 22pZD-9 CCD型X線検出器を用いたストップトフローX線溶液散乱法によるタンパク質のフォールデイング反応の研究
- 27aN-3 2次元CCD型検出器を用いたストップトフローX線溶液散乱法によるタンパク質のフォールディング反応の解析
- 退官者の挨拶・退官者を送る
- 1P014 グループII型シャペロニンにおけるHelical protrusionの役割(蛋白質 B) 構造・機能相関)
- 1P116トロポニンIはカルシウム依存的に二次構造変化を起こす
- 大腸菌シャペロニンGroELの作用機構の熱力学的解析
- 1p-YB-9 大腸菌シャペロニンGroELの作用機構の熱力学的解析
- 水と生体分子が織りなす生命現象(1)水と生体分子の物理化学の新展開
- 3P066SH3ドメインの変性状態の2次構造
- 3P056 ヒトα-LAの遷移状態の構造(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
- ヤギα-ラクトアルブミンα-ドメイン変異体の安定性とフォールディング反応
- 3M1045 CDおよび蛍光を用いたイヌミルクリゾチームのフォールディング機構の解析(1.蛋白質(C)物性,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)
- 3M1100 ヤギαラクトアルブミンCヘリックス変異体の巻き戻りとアンフォールディング(1.蛋白質(C)物性,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)
- 蛋白質フォールディングの2つの描像--普遍的描像は可能か? (特集 蛋白質フォールディングの諸問題)
- 3P024α-ラクトアルブミンのフォールディングの遷移状態解析
- 23pXB-12 分子ナノチューブによる線状高分子の包接ダイナミックス
- 1A1645 イヌ・ミルク・リゾチームの精製とフォールディング機構の研究
- 24pZC-11 分子ナノチューブと線状高分子の包接挙動
- 3P037 MDシミュレーションとクラスター解析を用いたα-ラクトアルブミンのアンフォールディング過程の観察(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
- 1P082 カルシウムイオン非存在下におけるヤギα-ラクトアルブミンのφ値解析(蛋白質 C) 物生(安定性、折れたたみなど)))
- 3P041 ヒトα-ラクトアルブミンの遷移状態の構造(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
- 3P040 緑色蛍光蛋白質GFPの酸変性と巻き戻り(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
- 1P135 真性体および組換え体α-ラクトアルブミンのアンフォールディング解析 : N末端メチオニン残基の影響(発生・分化)
- シャペロニンGroELがスタフィロコッカルヌクレアーゼの巻き戻りに及ぼす影響
- 緑色蛍光蛋白質変異体(Cycle3)の酸変性と巻き戻り
- 1I0945 緑色蛍光蛋白質変異体(Cycle3)の酸変性と巻き戻り(1.蛋白質(C)物性,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
- 3M1130 スタフィロコッカル・ヌクレアーゼのフォールディングにおける中間体の役割(1.蛋白質(C)物性,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)
- 3M1145 シャペロニンGroELがスタフィロコッカル・ヌクレアーゼの巻き戻りに与える影響(1.蛋白質(C)物性,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)
- 3P-1066 超好熱性古細菌由来II型シャペロニンの反応機構の速度論的解析(2a酵素学,酵素工学,一般講演,酵素学,タンパク質工学および酵素工学,伝統の技と先端科学技術の融合)
- 3P064 ペプチドタグを用いた蛋白質の溶解度向上の変異解析(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 2P111 1分子計測およびMDシミュレーションによるタンパク質アンフォールディングの確率的経路と複数の中間状態の検出(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 25aN-5 分子ナノチューブと線状高分子の包接ダイナミクス
- 1P092 プロリン残基を含まないスタフィロコッカル・ヌクレアーゼ変異体のNMRシグナルの帰属と天然条件下での水素・重水素交換法(蛋白質 C) 物生(安定性、折れたたみなど)))
- 1P040 グループII型シャペロニンのサブユニット間協同性におけるATPaseの役割(蛋白質(機能),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 1P039 蛍光プローブを用いたGroup II型シャペロニンのhelical protrusionの動的解析(蛋白質(機能),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 1YP1-02 キャピラリー内トラップによる一分子の長時間観察 : 蛋白質の折り畳みへの応用(1YP1 日本生物物理学会若手奨励賞選考会,第47回日本生物物理学会年会)
- 蛋白質を基板から解き放つ--蛋白質の折り畳み運動の解明を目指した--分子観察法の開発 (特集 生命機能を解き明かす最新計測技術)
- 22pZD-12 シャペロニンGroELへのヌクレオチド結合の熱力学的研究
- 2P091 高圧下温度ジャンプ装置による蛋白質のフォールディング過程の研究(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
- 3M1115 高圧下温度ジャンプ装置によるスタフィロコッカル・ヌクレアーゼ変異体のフォールディング過程の研究(1.蛋白質(C)物性,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)
- α-ラクトアルブミンの高温における分子動力学シミュレーション
- 構造安定化したα-ラクトアルブミン変異体の解析
- 3P05 構造安定化したα-ラクトアルブミン変異体の立体構造解析
- 1Q05 βラクトグロブリンの折れたたみ中間体
- 2P087 プロリン残基を含まないスタフィロコッカル・ヌクレアーゼ変異体のアンフォールディング転移の解析(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 1Q01 ヤギα-ラクトアルブミンとその変異体の折れ畳みの速度過程
- 2SD0905 蛋白質-分子の長時間蛍光観察法の開発 : 蛋白質の折りたたみへの応用(2SD 一分子生物物理学とシステムバイオロジーのかけ橋:実験家と理論家の挑戦,第48回日本生物物理学会年会)
- タンパク質のフォールディング速度と構造パラメータとの相関解析
- 23aPS-83 球状蛋白質の巻き戻り速度はどのような構造パラメータによって支配されているのか?
- 3P025pHジャンプ法によるスタフィロコッカル・ヌクレアーゼ(pro-)変異体のフォールディング機構の研究
- 3PA042 緑色傾向タンパク質(GFP)のフォールディング
- 大腸菌のシャペロニンGroEL/ES複合体と標的との相互作用
- 2Q29 変性状態の違いがジヒドロ葉酸還元酵素の巻き戻りに及ぼす影響
- 2Q05 ウマミルクリゾチームの折れたたみ機構
- 1P54 大腸菌シャペロニンGroELのヌクレオチドによる機能変化
- 1P116 シャペロニンGroELの第2のATP結合部位の探索(蛋白質 D) 機能(反応機構、生物活性など)))
- 2PA076 イヌミルクリゾチームのモルテングロブュール状態に関する蛋白質工学的研究
- 3PA113 大腸菌シャペロニンGroELへの非協同的ヌクレオチド結合
- N末近傍に変異を持つα-ラクトアルブミンのアンフォールディング解析 : 実験とシミュレーション
- 水と生体分子が織りなす生命現象(2)フォールディング実験とその分子動力学による再現
- 26pPSB-29 Outer surface protein Aのフォールディング機構(26pPSB 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- タンパク質の非天然構造とその生物的意義
- 3PA107 ATPase活性を失ったGroEL変異体(D398A)とαラクトアルブミン巻き戻り中間体との相互作用
- 序論 ポストゲノム時代のフォールディング研究 (特集 蛋白質フォールディングの諸問題)
- 3A1015 大腸菌シャペロニンGroELの変異体D398Aと標的蛋白質の相互作用
- 22pZD-11 大腸菌シャペロニンGroELの変異体D398Aと標的蛋白質の相互作用
- 1SB51 蛋白質のフォールディング機構(蛋白質と水の生物物理学)
- S2C04蛋白質フォールディングの統一的描像は可能か?
- ゲノム科学と物理化学との接点 : タンパク質フォールディング(ゲノム情報科学の新展開 : 生物物理の立場から)
- 生物物理 シャペロニン:タンパク質立体構造形成の分子機械 (特集 物理科学,この1年--1999年のニュース総まとめ)
- タンパク質のフォールディング問題 : 立体構造予測から分子病理まで
- 28a-S-3 蛋白質のフォールディング : 実験からの理解
- 1A01 はじめに
- GroELによる標的蛋白質認識の分子機構 (特集分子シャペロン)
- ウシα-ラクトアルブミンの構造形成と機能発現 : 牛乳の機能と物性 : シンポジウム(S-10)
- A. M. Lesk, Protein Architecture: A Practical Approach, IPL Press, Oxford, 1991, xiv+287p., 23×15cm
- タンパク質の折れたたみ
- 蛋白質フォールディングの中間体としてのモルテン・グロビュール状態 (<特集>蛋白質,この柔らかいもの : 非天然構造にスポットを当てる : III.非天然状態の構造を探る)
- 球状タンパク質フォ-ルディングの速度過程
- 29aPS-37 核磁気共鳴法とレプリカ交換分子動力学シミュレーションによるスタフィロコッカル・ヌクレアーゼの安定性とフォールディング/アンフォールディングの研究(29aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))