興奮性チャンネルを構成する螺旋状円筒状タンパク分子相互干渉エネルギーの計算
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概要
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生体膜上に存在するイオンチャンネル孔の開閉機構を明らかにする目的で円筒状ポリペプチド間の相互ポテンシアル計算方法を考案した。イオンチャンネル孔は通常4つから5つのサブユニットから構成されさらにサブユニットは6こ程度の円筒状のポリペプチドからなる。その表面には螺旋を形成しながら帯電したアミノ酸基が配列されている。チャンネルが開閉するばあい、この円筒状のポリペプチドが変形する。本研究では螺旋状に配列された電荷を配する2この平行は円筒状のポリペプチド間の相互作用を解析する方法を提案する。ポテンシアルはVan der Waals 力を想定し、電荷同士の幾何学的関係を精密に解析した。本研究を発展させることで、イオンチャンネル開閉における生体分子変形の電気的および分子間力の解析が可能となると推定した。
- 社団法人電子情報通信学会の論文
- 2002-09-13
著者
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