連続体円筒モデルによる有機分子としてのDNAのポテンシアル計算
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概要
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DNA分子を自由エネルギーの視点から解析する方法をBailey(1976)らの研究にもとずいて紹介し、DNAを構成するリン酸による負の電荷分布によるポテンシアルと静電力の三次元分布を計算した。DNA分子は円筒状とし、電荷(イオン)が存在しない内相とイオン同士が相互干渉しあう中間領域および外部電場を設定した。これらに対して、それぞれ、ラプラス方程式およびポアソン方程式を設定し2つの境界での連続性を境界条件として、Green関数を用いて、円筒座標系におけるポテンシアルを求めた。また円周方向に微分することで、静電力を算出し、それぞれの3次元分布をもとめた。ポテンシアルはDNAの円周方向で明確に変化した。静電力はそれより複雑な挙動をしめした。本研究を発展させることでDNA分子の自由エネルギーを計算することが可能である。
- 社団法人電子情報通信学会の論文
- 2001-01-11
著者
-
数井 暉久
浜松医科大学第一外科
-
数井 暉久
浜松医科大学付属病院第一外科(心臓血管外科)
-
数井 暉久
浜松医科大学医学部
-
数井 暉久
静岡大学 大学院電子科学研究科
-
平山 博史
旭川医科大学
-
沖田 善光
静岡大学大学院電子科学研究科
-
木村 元彦
静岡大学工学部
-
杉浦 敏文
静岡大学電子工学研究所
-
木村 元彦
静岡大学大学院 電子工学研究所
-
木村 元彦
静岡大学 工学部
-
木村 元彦
静岡大学工学部物質工学科
-
沖田 善光
静岡大学創造科学技術大学院
-
杉浦 敏文
静岡大学 創造科学技術大学院
-
杉浦 敏文
浜松医科大学
-
数井 暉久
浜松医科大学
-
杉浦 敏文
静岡大学大学院工学研究科:静岡大学電子工学研究所
-
杉浦 敏文
静岡大学
-
木村 元彦
静岡大学
-
沖田 善光
静岡大学
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