ブロムモザイクウイルスATCC 66株由来のcDNAクローンの塩基配列およびロシア株ゲノムとの比較

概要

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ブロムモザイクウイルス(BMV) ATCC 66株の感染性 in vitro RNAを転写できるcDNAクローン(KU 1株) の全塩基配列を決定し, BMVロシア株と比較した。BMV RNA 1, 2, 3それぞれにおけるKU 1株とロシア株の間での相同性は97%以上で, transitionタイプの置換がtransversionタイプの置換よりも多かった。Sindbis様植物RNA ウイルスに保存されている3つの領域でのアミノ酸変異のほとんどは類似アミノ酸への変換であった。RNA1と3の5'端非翻訳領域の塩基配列は両株間で完全に同じであったが, RNA 2では7つの塩基が異なっていた。いずれのRNA の3'端の塩基配列の変異も想定される2次構造に影響を与えないものであった。KU 1株, ATCC 66株ともに外被タンパク質遺伝子の5'端非翻訳領域において2つの隣接したアデニン塩基が欠失していた。RNA 3のシスロトン間領域に存在するオリゴ(A)配列のアデニンの数はATCC 66株では一定ではなく, KU 1株のRNA 3のcDNAでグアニン塩基が1個含まれていたのに対して, ATCC 66株のRNA 3では2個以上のグアニン塩基が認められた。
日本植物病理学会の論文
1994-08-25