分子認識の統計力学と生体機能
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
Recent progress in the theory of molecular recognition in biomolecules is reviewed, which has been made based on the statistical mechanics of liquids or the 3D-RISM/RISM theory. The molecular recognition of a ligand by the protein is realized by the 3D-distribution functions: if one finds some conspicuous peaks in the distribution of a ligand inside protein, then the ligand is regarded as “recognized” by the protein. 3D-distribution functions can be obtained by means of 3D-RISM/RISM theory. Some biochemical processes are investigated, which are intimately related to the molecular recognition of small ligands such as water, ions, and carbon monoxide by a protein.
- 日本生物物理学会の論文
著者
-
平田 文男
分子科学研
-
吉田 紀生
分子科学研究所
-
丸山 豊
分子科学研究所
-
PHONGPHANPHANEE Saree
分子科学研究所・理論・計算分子科学研究領域
-
清田 泰臣
分子科学研究所・理論・計算分子科学研究領域
関連論文
- 水の物性に見る量子化学的および古典統計的自由度の結合
- 超並列クラスタにおける3D-RISMへのVolumetric並列三次元FFTの適用と性能評価
- 1P44 生体内電子移動反応における溶媒効果
- 1J1615 RISM理論による溶媒効果を含むMet-enkephalinのレプリカ交換シミュレーション(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
- 1C1100 RISM理論を用いたMet-enkephalinのマルチカノニカルシミュレーション
- 超並列クラスタにおける3D-RISMへの Volumetric 並列三次元FFTの適用と性能評価
- 1P093 A Theoretical Analysis on the Free Energy Changes Associated with Protein Folding(3. Protein folding and misfolding (I),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)
- 28pRH-7 静電ポテンシャルの非線形ゆらぎと水和構造(28pRH 分子シミュレーション・溶液・液体,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 3P142 DNAの解離における溶媒の影響 : 3D-RISM方程式による解析(水・水和/電解質))
- 1P128 3次元RISM方程式によるDNAの水和の解析(水・水和/電解質)
- 30aWE-6 3次元RISM方程式によるDNAの水和の解析(生物理一般)(領域12)
- ベシクルの自己修復能 : 散逸粒子動力学法によるシミュレーション
- 28a-XC-13 様々なポテンシャルに対する2次元ラマンスペクトル
- 1p-YY-15 散逸のある様々な系におけるフォントンエコースペクトル
- 29p-YJ-12 多準位量子フォッカープランク方程式によるフェムト秒分光の解析(III)
- 多準位量子フォッカープランク方程式によるフェムト秒分光の解析(II)
- 量子フォッカー・ブランク方程式による光と分子の相互作用の解析
- 水中およびアルコール中におけるペプチドの立体構造解析
- タンパク質立体構造形成における溶媒効果
- Salt Effect on Stability and Solvation Structure of Peptide: An Integral Equation Study
- 22aZC-8 水和構造と電子移動反応
- 28p-XC-5 表面近傍での溶液構造と揺らぎ
- 25p-S-10 RISM積分方程式理論による部分モル体積の計算と圧力効果への応用
- 25p-S-4 電極-溶液界面の分子論的描像-4
- 30a-YY-8 電極-溶液界面の分子論的描像-3
- 5p-YL-17 電極-溶液界面の分子論的描像-2 : イオンの影響
- 3P48 蛋白質の立体構造予測 : RISMと徐冷法の結合
- 3P132 積分方程式を用いた溶液内生体分子の電子状態への溶媒効果に関する理論的研究(電子状態))
- 28p-F-12 電極-溶液界面の分子論的描像-1
- 1P-039 3次元RISM理論に基づくT4リゾチーム変異体におけるベンゼン結合部位の理論的同定(蛋白質・構造機能相関(1),第46回日本生物物理学会年会)
- 2P415 Probing for hydrophobic molecules in cavities and clefts of a protein by the 3D-RISM theory(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)
- 3SA2-02 分子認識と麻酔に関する統計力学的研究(3SA2 麻酔作用の分子機構 : 生物物理から明らかにされる生体分子と麻酔薬の相互作用,第47回日本生物物理学会年会)
- 化学における液体論の新展開(若手による溶液化学の新展開)
- グリッドコンピューティングが拓くナノサイエンス--計算科学的手法を用いた化学の新しい動き
- 分子認識の統計力学と生体機能
- 分子認識の統計力学と生体機能
- 1SQ-06 化学的特殊性と物理的一般性を併せ持つ理論による生命現象の探求(1SQ 日本生物物理学会-イスラエル生物物理学会合同シンポジウム"タンパク質動力学-一分子から綱胞まで",日本生物物理学会第49回年会(2011年度))
- 液体の積分方程式理論と電子状態理論のハイブリッドによる溶液内分子の電子状態理論 (特集 電子状態理論を核とする新しいハイブリッド型分子理論の展開)