X線自由電子レーザー施設SACLAとスーパーコンピューター「京」の連携(ネットワーク研究開発テストベッド運用・利用,一般)

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概要

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• X線自由電子レーザー施設SACLAは、超短パルス・高輝度のコヒーレントX線を用いることで、生命科学・物質科学など多分野における利用を目指している。利用研究の一つであるコヒーレント回折イメージング実験では、非結晶状態のタンパク質の構造解析の実現が期待されている。原子レベルの立体構造を解析するためには、X線回折画像を数百万枚取得し解析する必要があるため、「京」を含むHPCI共用計算資源と連携したSACLA実験データ解析基盤の構築が求められている。特に実験中におけるデータの質の診断と実験条件へのフィードバックが重要であり、実験を遂行しながら高度な解析を実施するためのシステム連携が必要となる。SACLAと「京」を連携して利用するための技術検証として、SINET4を利用したFOCUSおよびe-Science西拠点へのデータ転送試験を実施した。

• 一般社団法人電子情報通信学会の論文
• 2012-10-05

著者

• 石川 裕

  東京大学情報基盤センター

• 初井 宇記

  理研XFEL

• 黒川 原佳

  独立行政法人理化学研究所

• 大端 通

  財団法人高輝度光科学研究センター

• 亀山 豊久

  理化学研究所計算科学研究機構

• 杉本 崇

  財団法人高輝度光科学研究センター 制御・情報部門

• 田中 良太郎

  財団法人高輝度光科学研究センター 制御・情報部門

• 山鹿 光裕

  財団法人高輝度光科学研究センター 制御・情報部門

• 城地 保昌

  高輝度光科学研究センター

• 大端 通

  高輝度光科学研究センター

• 横川 三津夫

  独立行政法人理化学研究所

• 庄司 文由

  独立行政法人理化学研究所計算科学研究機構

• 庄司 文由

  (独)理化学研究所 次世代スーパーコンピュータ開発実施本部 開発グループ

• 亀山 豊久

  独立行政法人理化学研究所計算科学研究機構

• 杉本 崇

  公益財団法人高輝度光科学研究センター

• 城地 保昌

  公益財団法人高輝度光科学研究センター

• 間山 皇

  公益財団法人高輝度光科学研究センター

• 大端 通

  公益財団法人高輝度光科学研究センター

• 坂本 達亮

  公益財団法人高輝度光科学研究センター

• 田中 良太郎

  公益財団法人高輝度光科学研究センター

• 山鹿 光裕

  公益財団法人高輝度光科学研究センター

• 初井 宇記

  公益財団法人高輝度光科学研究センター

• 西川 武志

  財団法人計算科学振興財団

• 横川 三津夫

  独立行政法人理化学研究所計算科学研究機構

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