細胞分化解析を目指した網羅的ヒト細胞データベース「CELLPEDIA」
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
本研究では、細胞を人体の物理的な位置に基づいて 2000 種類以上に細分化し、細胞画像、形態値、文献、遺伝子発現データを収集し統合した、細胞の網羅的データベースを作成した.さらに成体の組織幹細胞、前駆細胞を約 60 種類に分類し、情報を収集した.本データベースを用いることにより、細胞の形態値、遺伝子発現データをもとに、細胞の個性を定量的に解析することが可能である.
- 2010-02-25
著者
-
藤渕 航
産業技術総合研究所生命情報科学研究センター
-
山根木 康嗣
兵庫医科大学病理学第1講座
-
藤渕 航
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
-
千葉 啓和
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
-
千葉 啓和
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
-
藤渕 航
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
-
幡野 晶子
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター|東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科
-
谷口 丈晃
(株)三菱総合研究所
-
永家 聖
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター|東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科
-
山根木 康嗣
兵庫医科大学病理学講座機能病理部門
関連論文
- ヒト大腸癌細胞同所移植自然転移モデルを用いた転移能に相関する遺伝子発現プロファイルの解析(続報)
- Laser Microdissection法とcDNA microarray法を用いた大腸癌病理組織形態に特異的な遺伝子発現プロファイルの解明
- cDNA microarray解析を用いた,ヒト大腸癌細胞株における5-FU感受性規定遺伝子の同定と,新規感受性予測法
- ヒト大腸癌細胞株を用いた新規5-FU感受性・耐性規定遺伝子のスクリーニングと機能解析(第105回日本外科学会定期学術集会)
- SF-017-3 大腸癌の5-FU治療抵抗性克服に向けた耐性規定遺伝子群の包括的解析(大腸がん(基礎研究3),サージカルフォーラム,第109回日本外科学会定期学術集会)
- DP-097-4 ヒト大腸癌細胞同所移植自然転移モデルを用いたリンパ節転移能と遺伝子発現プロファイルの解析(続報)(第108回日本外科学会定期学術集会)
- 胆嚢 Mucin-producing papillary adenocarcinoma の1例
- 胆嚢 hepatoid adenocarcinoma の1例
- 免疫組織化学的にアポクリン細胞および神経内分泌細胞への分化を伴った乳腺 glycogen-rich clear cell carcinoma の1例
- びまん性肺骨形成 (diffuse pulmonary ossification ; DPO) の1例
- DP-158-3 Gene Set Enrichment Analysisを用いたオキサリプラチン,イリノテカン,5-FU感受性に関わる機能遺伝子セットの同定(第108回日本外科学会定期学術集会)
- WS-3-3 外科切除標本と生命科学情報データベースを駆使した胃癌特異的なsplicing variantの同定とその臨床応用(第108回日本外科学会定期学術集会)
- P-1-510 大腸癌細胞同所移植自然転移モデルを用いた転移能と遺伝子発現プロファイルの解析(続報)(大腸・肛門 基礎1,一般演題(ポスター),第62回日本消化器外科学会定期学術総会)
- DP-052-8 大腸癌のリンパ節転移に関与する遺伝子群の同定と解析(第107回日本外科学会定期学術集会)
- SF-026-1 当科での癌研究への取り組みと今後の展望(オンコロジストのための基礎研究,サージカルフォーラム,第110回日本外科学会定期学術集会)
- 0333 大腸癌細胞同所移植転移モデルでの転移能に相関する遺伝子発現プロファイル解析(続報)(大腸癌基礎2,一般演題,第61回日本消化器外科学会定期学術総会)
- 極大2部クリーク列挙法による遺伝子発現モジュールの抽出(遺伝子発現・ネットワーク)
- 正則化正準相関解析を用いた抗がん剤の影響による共通パスウェイ解析
- ネットワーク型雑音除去によるマイクロアレイデータからの薬剤耐性予測(機械学習によるバイオデータマイニング)
- ネットワーク型雑音除去によるマイクロアレイデータから由薬剤耐性予測(機械学習によるバイオデータマインニング)
- FPGAを用いた高速プライマー配列探索システムの開発
- 正則化正準相関解析を用いた抗がん剤の影響による共通パスウェイ解析
- 2-way prediction法によるGPCRリガンドの結合予測
- 細胞分化解析を目指した網羅的ヒト細胞データベース「CELLPEDIA」
- 細胞の知識ベース開発と遺伝子発現プロファイルによる細胞種と特徴予測(Expression analysis)
- ガイドクラスタリングとネットワーク分割法を用いた土壌メタゲノムからの新規キシロース代謝酵素の探索
- 歯周病細菌感染に起因したと考えられる化膿性肝膿瘍の1剖検例
- SF-050-5 消化器癌における選択的pre-mRNAスプライシングの制御の異常の解明と個別化治療への応用(SF-050 サージカルフォーラム(50)大腸 分子標的療法,第112回日本外科学会定期学術集会)
- SF-019-6 胃癌・大腸癌におけるフッ化ピリミジン系抗癌剤の効果と有害事象を規定する遺伝子群の解折(SF-019 サージカルフォーラム(19)基礎-2(バイオマーカー),第112回日本外科学会定期学術集会)
- PS-376-3 cIAP2を標的とする消化器癌の新規治療戦略の提案(PS ポスターセッション,第113回日本外科学会定期学術集会)
- PS-071-6 ヒト大腸癌細胞株マウス同所移植モデルを用いた上皮間葉転換及び転移カスケードの解析(PS ポスターセッション,第113回日本外科学会定期学術集会)
- Stem Cell Informatics Database:多様なヒト細胞情報の統合化を目指したデータベースの構築