ガイドクラスタリングとネットワーク分割法を用いた土壌メタゲノムからの新規キシロース代謝酵素の探索
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概要
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メタゲノム解析は難培養性微生物の遺伝子の収集を可能にしたが遺伝子が由来するゲノムを判別することは難しい.我々はこの問題を解決するためにクラスター解析とネットワーク分割アルゴリズムを併用した判別手法を開発した.難培養性微生物に由来する糖代謝遺伝子xylAはバイオエタノールの生産効率に寄与している.本手法を適用して土壌メタゲノムからxylA遺伝子が由来するゲノムを推定した.今学会でその成果を報告する.
- 2012-03-21
著者
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藤渕 航
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
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竹山 春子
早稲田大学先進理工学部生命医科学科
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千葉 啓和
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
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藤渕 航
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
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根本 賢作
早稲田大学大学院先進理工学研究科
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千葉 啓和
独立行政法人産業技術総合研究所生命情報工学研究センター|独立行政法人自然科学研究機構基礎生物学研究所
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藤渕 航
早稲田大学大学院先進理工学研究科|独立行政法人産業技術総合研究所生命情報工学研究センター|東京医科歯科大学大学院生命情報科学教育部|東京大学新領域情報生命科学専攻|京都大学iPS細胞研究所
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竹山 春子
早稲田大学大学院先進理工学研究科
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