遺伝子発現プロファイルによるネットワーク構造評価(システムバイオロジー,システムバイオロジー,一般)
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概要
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解析対象のネットワーク構造とその構成分子に関する計測データとが与えられたとき,ネットワーク構造と計測データとの適合度を評価する手法を提案する.シミュレーションにより提案手法が効果的に機能することを示した後,大腸菌SOSネットワークおよび構成遺伝子のプロモーター活性データに適用し,提案手法が計測データに適用可能であることを示す.最後に,多数の既知ネットワーク構造群から特異的条件で計測されたデータに適合するネットワークを同定する,"ネットワークスクリーニング"という概念を提案し,その実行例を示すと共に有用性を議論する.
- 2009-07-30
著者
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堀本 勝久
産業技術総合研究所生命情報工学研究センター
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齊藤 秀
インフォコム株式会社ケム&バイオ・インフォマティクス部:産業技術総合研究所生命情報工学センター
-
堀本 勝久
産業技術総合研究所・生命情報工学研究センタ
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