グループ列分割に基づくインフルエンザウイルスのアミノ酸置換における時代的変化の解析
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概要
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インフルエンザウイルスの遺伝子は突然変異を起こしやすい.抗体による免疫圧力によって,抗原性が変化したウイルスのみが生き残り,次の流行を引き起こす.ウイルスの進化の詳細を理解するために,本論文では,インフルエンザウイルスの進化において,アミノ酸置換の起こる残基位置が時代と共に変化するか否かを明らかにすることを目的とする.コントラストセットマイニングの枠組みを用いて,隣接するグループ列間の特徴的違いを発見するアルゴリズムを提案し,進化系統解析と提案手法を組み合わせることによって,アミノ酸置換の起こる残基位置の時代的変化を解析する.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2007-12-20
著者
-
伊藤 公人
北海道大学人獣共通感染症リサーチセンター
-
原口 誠
北海道大学大学院情報科学研究科
-
谷口 剛
北海道大学,大学院情報科学研究科
-
原口 誠
東京工業大学
-
原口 誠
北海道大学 大学院工学研究科
-
谷口 剛
北海道大学 大学院情報科学研究科
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