ゲノムアプリケーションInterProScanのスケジューリング機能の検討(EVA-1:科学技術計算アプリケーションの評価,2003年並列/分散/協調処理に関する『松江』サマー・ワークショップ(SWoPP松江2003))
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概要
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InterProScanは有用なゲノムアプリケーションとして広く利用されているが,非常に多くの実行時間を要する.InterProScanの実行時間を短縮するために,Grid環境のような大規模な計算機環境の利用が考えられる.しかし,InterProScanには,単純なスケジューリング機能しか実装されておらず,そのままではGrid環境の大量の計算機を有効に利用することができない.InterProScanをGrid環境で実行するには新たなスケジューリング機能が必要となる.本研究では,Grid環境を対象にInterProScanスケジューリング機能を実装し,性能評価を行う.
- 社団法人情報処理学会の論文
- 2003-08-06
著者
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