生体分子間相互作用と局在に関する空間シミュレーションモデル
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概要
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分子イメージング技術の進歩によって細胞内における時空間の分子運動を視覚化することができるようになった.しかしながら,観察された分子レベルの運動がどのようなメカニズムの帰結として生じているのかについての説明はこれまでのところ推測の域を出ていないようである.我々は細胞における分子運動,相互作用,局在,などの理論解析のための,三次元空間内における粒子の反応拡散シミュレーションアルゴリズムを提案する.細胞表面における分子間相互作用のシミュレーションを行うことにより,クラスタリングドメイン(約02μm)の生成を見い出した.このドメインを構成する分子の軌跡は「ホップ拡散」を再現する.これらの結果は,局在を理論的に解析するために,我々のアプローチが有望であることを示している.
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2007-10-15
著者
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小長谷 明彦
理化学研究所ゲノム情報科学研究グループ
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山本 知幸
北陸先端科学技術大学院大学知識科学研究科
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小林 弘
千葉大学大学院薬学研究院
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我妻 竜三
理化学研究所ゲノム科学総合研究センター
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小長谷 明彦
理研 ゲノム科学総合研究セ
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