細胞分裂周期マイクロアレイ実験における正弦回帰を用いない遺伝子配列法(セッション6)

スポンサーリンク

概要

• 論文の詳細を見る

• 遺伝子発現プロファイルの時系列データの解析は重要な問題だが、同時に困難でもある。本論文ではサイズ同期を用いた分裂酵母の細胞分裂周期のマイクロアレイ実験に注目する。従来の正弦回帰を仮定した解析を細砲分裂周期のマイクロアレイ実験データに応用するといろいろ問題点があることを指摘した後、代替手法として非計量多次元尺度構成法(nMDS)を提案する。nMDSは遺伝子発現データの解析に用いられる最も仮定の少ない手法であるので仮定が少ない方がより多くの情報を得ることができると言うことができる。

• 一般社団法人情報処理学会の論文
• 2006-12-21

著者

• 田口 善弘

  東工大 物理

• 田口 善弘

  中大理工

• 田口 善弘

  中央大学理工学研究科

• 田口 善弘

  東京工業大学理学部物理教室

• 田口 善弘

  東工大理

• 田口 善弘

  中央大学理工学部物理学科

• 田口 善弘

  中央大学理工学研究科:中央大学理工学研究所

• 田口 善弘

  中央大学

• 田口 善弘

  東京工業大学

関連論文

• マルコフ確率場を使ったタンパク質機能予測
• 粒子径と粒子密度の双方を考慮した偏折現象の解析
• 離散要素法を用いた装入物の落下・堆積挙動の検討(離散要素法による装入物分布予測モデルの開発-2)
• 18pTC-10 シアノバクテリア概日周期の発光レポーターによる計測データの非計量多次元尺度構成法による解析(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 27aU-7 多次元尺度構成法による土壌微生物多様度解析
• 第40回地盤工学シンポジウム開催報告
• 30aYF-6 食物網モデルの種機能空間安定性
• Stochastic shell model : 乱流におけるanomalousスケーリングと非ガウス分布の一つのモデル(流れの安定性と乱流統計)
• 12aTC-6 ニューラルネットによる進化と環境(生態系・ゲーム等, 領域 11)
• 29pWE-12 バルハン砂丘の形態・分布の数値計算モデル
• 粉体振動層における逆毛細管現象
• 量子的なスピングラスの基底状態の数値的研究(F.スピングラスの理論,基研短期研究会「スピングラスとその周辺」,研究会報告)
• アンケートにみる中央大学物理学科の新入生像
• シェアのかかった非弾性衝突球系の速度分布
• 星野 力, 誰がどうやってコンピュータを創ったのか?, 共立出版, 東京, 1995, vi+158p., 21×15cm, 2,200円 [一般書]
• 星間乱流と粉体乱流
• 奈良重俊, ピーター・ディビス, カオスと知的情報処理; カオスは本当に役に立つのか , ジャストシステム, 徳島・東京, 1994, 204p., 18×13cm, 1,450円, Just Book 6
• 31p-E-8 理想粉粒体の提案
• 乱流に「中身」はあるか?[1](乱流をめぐる総合討論,基研短期研究会「複合系における動力学の新展開」,研究会報告)
• 木田重雄, いまさら流体力学?, 丸善, 東京, 1994, x+198p., 19×13cm, 1,339円
• パリティ編集委員会編, カオス : 複雑さに内在する規則性, 丸善, 1994, 124, 28.5×21cm, 3,811円, パリティ別冊シリ-ズNo.10
• 2p-YB-6 流体乱流の非ガウス分布の数値モデル
• 3a-C-4 粉体乱流の非ガウス分布
• A. Mehta, ed., Granular Matter; An Interdisciplinary Apprach, Springer-Verlag, Berlin and Hidelberg, 1994, xi+306p., 24×16cm, 15,800円
• 平田氏のコメントに答えて
• 28p-C-11 粉体振動層における乱流II
• 粉体振動層における乱流(基研長期研究会「複雑系2」〜物理から生物・進化・ゲームへ〜,研究会報告)
• 多体問題の数値モデル化について(モデルの作り方と評価を巡って-Short talks & Panel discussions-,基研長期研究会「複雑系2」〜物理から生物・進化・ゲームへ〜,研究会報告)
• 重力下の粉粒体の動力学
• 13a-F-1 粉体振動層におけるk_スペクトラム
• 30a-F-11 破壊の動的モデリング
• マルチフラクタル解析の有限サイズ効果(カオスとその周辺,研究会報告)
• タンパク質フォールド予測におけるアミノ酸残基頻度/比率の比較
• 19aTC-12 アミノ酸残基使用頻度を用いたタンパク質フォールド予測(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 20pXJ-1 講義アンケートの解析XI(物理教育,領域13,物理教育,物理学史,環境物理)
• 24aRC-2 分裂酵母の正弦回帰を用いない細胞周期遺伝子の検出II(24aRC 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 23pWA-12 講義アンケートの解析X(23pWA 物理教育,領域13(物理教育,物理学史,環境物理))
• 30pUA-15 非計量多次元尺度構成法による顔検出アルゴリズム(30pUA 情報統計力学,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 27pTH-7 分裂酵母の正弦回帰を用いない細胞周期遺伝子の検出(27pTH 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 28aZA-7 講義アンケートの解析IX(28aZA 物理教育,領域13(物理教育,物理学史,環境物理))
• 26pYW-8 非計量多次元尺度構成法を用いた遺伝子発現実験のノイズリダクション(生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 14pTD-2 順位相関による画像の統計的特徴抽出(情報統計力学, 領域 11)
• 14pTD-1 非計量多次元尺度構成法による画像処理基礎技術(情報統計力学, 領域 11)
• 13pTK-8 病原体の進化 2(生物系, 領域 11)
• 13aTC-11 ニューラルネットワークによる平面画像から三次元画像を構築する視覚のモデル(ニューラルネットワーク : 神経系のモデルを含む, 領域 11)
• 28aYB-7 業績評価の立場から(物理と社会シンポジウム : 研究者の評価をめぐって)(物理と社会)
• 28aYB-1 アンケート分析1 : 業績指標を中心に(物理と社会シンポジウム : 研究者の評価をめぐって)(物理と社会)
• 28aYB-7 業績評価の立場から(物理と社会シンポジウム : 研究者の評価をめぐって)(物理と社会)
• 28aYB-1 アンケート分析1 : 業績指標を中心に(物理と社会シンポジウム : 研究者の評価をめぐって)(物理と社会)
• 28aYB-7 業績評価の立場から(物理と社会シンポジウム : 研究者の評価をめぐって)
• 28aYB-1 アンケート分析1 : 業績指標を中心に(物理と社会シンポジウム : 研究者の評価をめぐって)
• 28aYB-7 業績評価の立場から(物理と社会シンポジウム : 研究者の評価をめぐって)(物理と社会)
• ベイズ統計を用いた顔性差認知モデル(一般セッション(1),受け容れるインターフェース,および一般)
• 非計量多次元尺度構成法によるゲノムコピー数解析
• 粉体は数理科学の対象となりうるか
• ミツバチ幼虫成長過程のたんぱく質発現の非計量多次元尺度構成法による解析
• 22aWD-13 トビヘビの滑空モデル
• 20pTQ-3 病原体の進化
• 非計量多次元尺度構成法を用いたマイクロアレイ実験におけるノイズ低減(Expression analysis)
• 非計量多次元尺度構成法とその生体生命情報解析への応用(非線形科学と統計科学の対話,研究会報告)
• 阪口秀,草野完也,末次大輔編, 『階層構造の科学 宇宙・地球・生命をつなぐ新しい視点』, 東京大学出版会, 227ページ, 2800円(本体価格), 2008年
• 非計量多次元尺度構成法を用いたガン細胞判別(一般セッション2)
• マイクロアレイにおける二遺伝子間の相関係数の非計量多次元尺度構成法を用いたロブストな計量
• 細胞分裂周期マイクロアレイ実験における正弦回帰を用いない遺伝子配列法(セッション6)
• 細胞分裂周期マイクロアレイ実験における正弦回帰を用いない遺伝子配列法(セッション6)
• 分裂酵母の細胞周期遺伝子の正弦回帰を仮定しない検出(Expression analysis)
• 西野友年著, 『ゼロから学ぶベクトル解析』, 講談社, 214頁, 2500円(本体価格), 2002年5月10日
• 7. 大学の立場から(特集: B 新学習指導要領・理科についての意見,新学習指導要領について)
• 3つの法則
• Markov random field models for protein function prediction (バイオ情報学)
• Barcode of Lifeによる非計量法の利用(セッション2:『機械学習によるバイオデータマインニング』)
• 28aZD-9 C. elegans のマイクロアレイデータの非計量多次元尺度構成法による解析 II
• 18aRH-12 AAA蛋白の多次元尺度構成法による分類
• 18aRH-11 脳波データの多次元尺度法による解析
• 主成分分析によるバクテリアのプロテオーム解析
• フロ桶はいついっぱいになる? (特集 解いてみよう2007夏)
• 自然界に現れるランダムネス (ランダムネス--その美しさ,おもしろさ,不思議さ)
• 28aYB-1 アンケート分析1 : 業績指標を中心に(物理と社会シンポジウム : 研究者の評価をめぐって)(物理と社会)
• 20aXD-10 講義アンケートの解析 V
• 23aWF-4 2 次元粉体振動層の数値計算での粉体温度の測定
• 22aWD-14 多変量解析を用いた力学系の埋め込み次元解析
• 30pZN-4 男性から見た男女共同参画
• 30pZN-4 男性から見た男女共同参画
• 30pZN-4 男性から見た男女共同参画
• 29aZM-9 家庭学習時間に対する自習課題の効果
• 29pWE-13 粉体振動層の粉体温度
• 30pZN-4 男性から見た男女共同参画
• 17aYC-7 講義アンケートの解析II
• 19pPSA-36 二種混合振動粉体層の数値計算
• D. ben-Avraham and Shlomo Havlin, Diffusion and Reactions in Fractals and Disordered Systems, Cambridge Univ. Press, Cambridge, 2000, xiv+316p., 25×17.5cm, £55, [大学院向・専門書]
• 28pYW-5 講義アンケートの解析
• G. H. Ristow, Pattern Formation in Granular Materials, Spring-Verlag, Berlin and Heidelberg, 2000, xiii+161p., 24×16cm, \13,350, (Springer Tracts in Modern Physics,Vol.164), [大学院向・専門書] : J. Duran, Sand, Powders and Grains; An Introduction to the Physics o
• 24pU-8 逆偏析の数値計算
• マルクス・ジョルジュ(盛田常夫 編訳), 『異星人伝説-20世紀を創ったハンガリー人』, 日本評論社, 352頁, 2900円(本体価格), 2001年12月
• "砂上の楼閣"の物理学
• 粉粒体は「流れる」か?
• 肝疾患におけるmicroRNA診断 (特集 疾患エクソソーム : 病をもたらすパンドラの箱がいま開かれる : エクソソームを制するものが疾患を制する) -- (エクソソームを用いた疾患の診断・治療)
• 24aBD-7 土壌病害の総合防除対策が土壌微生物生態系に及ぼす影響II : 理論(24aBD 生物・生態系1,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 24aBD-6 土壌病害の総合防除対策が土壌微生物生態系に及ぼす影響I : 観測(24aBD 生物・生態系1,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 6pTD-8 混合粉体振動層の数値計算(粉流体・流体,領域11)

もっと見る 閉じる

スポンサーリンク