分裂酵母の細胞周期遺伝子の正弦回帰を仮定しない検出(Expression analysis)
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概要
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マイクロアレイは遺伝子発現プロファイルの研究に広く使われているが、その解釈は単純でない。我々は数千個の遺伝子を容易に処理できる非計量多次元尺度法のアルゴリズムを開発しているので、相関係数を類似度に採用した同手法を分裂酵母の全遺伝子についての最近のマイクロアレイ実験の解析に適用した。得られた二次元埋め込み空間での遺伝子の角座標は正弦回帰を仮定した既存の結果で見出された遺伝子の細胞周期の段階によく対応している。われわれの細胞周期同期遺伝子抽出法は従来の方法のような遺伝子表現レベルの時間依存性に周期性を仮定する方法ではないので、この結果は分裂酵母についての従来の結果の信頼性を示している。
- 一般社団法人情報処理学会の論文
- 2005-12-22
著者
-
田口 善弘
東工大 物理
-
田口 善弘
中大理工
-
田口 善弘
中央大学理工学研究科
-
田口 善弘
東京工業大学理学部物理教室
-
田口 善弘
東工大理
-
田口 善弘
中央大学理工学部物理学科
-
田口 善弘
中央大学理工学研究科:中央大学理工学研究所
-
田口 善弘
中央大学
-
田口 善弘
東京工業大学
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