マルチドメインを考慮したオーソログ遺伝子対の検出アルゴリズムの開発 : 植物と細菌の遺伝子の対応付けを目指す(アルゴリズム)

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概要

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様々な生物のゲノム全配列が解析され、異なる生物種間で全遺伝子を比較解析することでオーソログ遺伝子対を検出することが可能となった。しかしながら、遺伝子は進化の過程でドメインが融合したマルチドメイン構造を形成する場合があるため、ホモロジー解析で得られた遺伝子の類似箇所の情報を考慮していない単純なクラスタリングに基づく解析手法では、遺伝子の相同関係が一対多や多対多になってしまい、オーソログ遺伝子を決定する際に問題が生じる。この問題を解消するため、本研究では、遺伝子の相同関係をドメイン単位で検出し、オーソログ遺伝子をドメイン単位で解析することを可能にする、マルチドメインの関係性を可視化するソフトウェアの開発を行った。また、本ソフトウェアを用いた、植物と細菌の遺伝子のゲノムレベルでの進化解析を行った。
2006-06-15

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