Highly Sensitive Real-Time PCR Assay for Quantification of Toxic Cyanobacteria Based on Microcystin Synthetase A Gene(ENVIRONMENTAL BIOTECHNOLOGY)
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概要
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The presence of cyanobacterial bloom in water supply reservoirs can cause potential health hazards. In this study, we aimed at the quantification of microcystin-producing cyanobacteria based on the microcystin synthetase A (mcyA) gene using real-time PCR. To perform a highly sensitive real-time PCR assay, the novel primer MSR-2R was designed and a coprecipitation DNA extraction method was used in this study. Cyanobacterial cells could be collected efficiently by coprecipitation with other bacteria suspended in solution even in the case of low concentrations of cyanobacteria. The detection limit of the method was found to be 8.8 cells per reaction. When cyanobacterial growth was monitored in pure culture, the cell concentration determined by real-time PCR positively correlated with the cell concentration determined from direct microscopic count. Furthermore, we could detect and quantify the mcyA gene in lake water samples using real-time PCR. It was concluded that the quantification of the mcyA gene based on real-time PCR is a powerful tool for the rapid quantification of microcystin-producing cyanobacteria in environmental samples.
- 2006-08-25
著者
-
Tsuneda Satoshi
Department of Life Science and Medical Bioscience, Waseda University
-
常田 聡
早稲田大学理工学部生命医科学科
-
Furukawa Kazuhiro
Department of Chemical Engineering, Waseda University
-
Noda Naohiro
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
-
Saito Takeshi
National Institute for Environmental Studies
-
Itayama Tomoaki
National Institute for Environmental Studies
-
Inamori Yuhei
National Institute for Environmental Studies
-
Inamori Y
National Institute For Environmental Studies
-
Inamori Yuhei
Regional Environment Division National Institute For Environmental Studies
-
Tsuneda Satoshi
Department Of Chemical Engineering Waseda University
-
Noda Naohiro
Institute For Biological Resources And Functions National Institute Of Advanced Industrial Science A
-
INAMORI Yuhei
Fukushima Univ.
-
Furukawa Kazuhiro
Department Of Chemical Engineering Waseda University
-
Inamori Yuhei
Facility Of Symbiotic System Science Fukushima University
-
Saito Takeshi
National Agricultural Research Center For Western Region
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