29pZD-6 拡張アンサンブル法による膜タンパク質のヘリックス配置予測

スポンサーリンク

概要

• 論文の詳細を見る
• 社団法人日本物理学会の論文
• 2003-03-06

著者

• 岡本 祐幸

  名古屋大学大学院理学研究科

• 小久保 裕功

  総研大

• 岡本 祐幸

  総研大

関連論文

• 23aED-6 タンパク質系のシミュレーションに用いる主鎖二面角エネルギー項の改良(23aED 電子状態・化学反応・分子構造,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 遺伝的交叉を用いた並列SAによるタンパク質立体構造のエネルギー最小化(並列処理アルゴリズムと評価)
• 127 遺伝的交叉を用いた並列シミュレーテッドアニーリングによるタンパク質立体構造予測
• 29pVC-1 はじめに(29pVC 領域12,領域9合同シンポジウム:結晶成長とアミロイド病の物理学,領域9(表面・界面,結晶成長))
• 29pVC-1 はじめに(29pVC 領域12,領域9合同シンポジウム:結晶成長とアミロイド病の物理学,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 21pRK-10 マルチバーリック・マルチサーマル分子動力学法によるアラニンジペプチドの力場依存性(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 19aTC-3 マルチバーリック・マルチサーマル分子動力学法によるアラニンジペプチドの温度・圧力依存性(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 生体系における大規模分子シミュレーション(地球シミュレータ(続))
• 拡張アンサンブル法による膜タンパク質の立体構造予測 (特集 予測と発見)
• マルチバーリック・マルチサーマルアンサンブルにおけるレナード・ジョーンズ流体のシミュレーション(2004年度後期基礎物理学研究所研究会「モンテカルロ法の新展開3」,研究会報告)
• 2P063 拡張定温定圧アンサンブルにおけるペプチドの分子動力学シミュレーション(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
• 21pXG-11 ペプチドのマルチバーリック・マルチサーマル分子動力学シミュレーション(生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• PDBデータベースを用いたタンパク質力場パラメータの最適化
• 水と生体分子が織りなす生命現象(3)タンパク質のフォールディングシミュレーションから立体構造予測問題に迫る
• 2P057 レプリカ交換法を用いたX線1分子計測法によるたんぱく質の構造解析のシミュレーション(蛋白質 A) 構造)
• 1P116 拡張アンサンブルシミュレーションによる膜タンパク質立体構造の自己形成(膜蛋白質)
• 28aWE-6 マルチバーリックマルチサーマル法による液体のシミュレーション(化学物理理論)(領域12)
• レプリカ交換法による膜タンパク質の立体構造予測(ソフトマターの物理学2003-普遍性と多様性-,研究会報告)
• 蛋白質折り畳みの計算機シミュレーション(数学者のための分子生物学入門,研究会報告)
• レプリカ交換法による膜タンパク質の立体構造予測
• PDBデータベースによるタンパク質系の力場パラメータの最適化
• 21aZA-12 マルチバーリックマルチサーマルモンテカルロ法による気液相転移の理論的研究
• 3P063プロテインGのモデル溶媒中での拡張アンサンブルシミュレーション
• 1J1615 RISM理論による溶媒効果を含むMet-enkephalinのレプリカ交換シミュレーション(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 27pZC-10 Potts模型系の拡張アンサンブルシミュレーション
• 1C1100 RISM理論を用いたMet-enkephalinのマルチカノニカルシミュレーション
• 徐冷モンテカルロシミュレーションによるβ-Lactoglobulinのfragmentのαヘリックス形成傾向性の研究
• 27a-S-5 マルチカノニカル法を用いた真空中でのMet-Enkephalinの構造の分類
• 水中およびアルコール中におけるペプチドの立体構造解析
• タンパク質立体構造形成における溶媒効果
• 3P48 蛋白質の立体構造予測 : RISMと徐冷法の結合
• 遺伝的交叉を用いた並列シミュレーテッドアニーリングの検討
• 遺伝的交叉を用いた並列シミュレーテッドアニーリングの検討
• 29pPSB-33 Multi-overlap分子動力学法によるペプチドのシミュレーション(ソフトマスター・化学物理・生物物理)(領域12ポスターセッション)
• 1P027水中のペプチド構造探索のための新拡張アンサンブル法の開発とその比較
• 22aXA-10 マルチカノニカル法上レプリカ交換法の統合による新拡張アンサンブル法の開発
• 407 遺伝的アルゴリズムの交叉の概念を取り入れた分子動力学法の拡張手法の提案(進化的計算とその応用(2),OS16 進化的計算とその応用)
• B-016 NetSolveを用いたPSA/GAcによるタンパク質立体構造予測(B.ソフトウェア)
• A-021 連続最適化問題におけるシミュレーテッドアニーリングアルゴリズムの解探索性能の比較(A.モデル・アルゴリズム・プログラミング)
• シミュレーテッドアニーリングを用いたタンパク質立体構造エネルギ最小化における温度パラメータの検討(バイオインフォマティック)
• 29pZD-6 拡張アンサンブル法による膜タンパク質のヘリックス配置予測
• 拡張アンサンブル法で探る蛋白質の折り畳み機構(拡張アンサンブル,1998年度後期基礎物理学研究所研究会「モンテカルロ法の新展開」,研究会報告)
• 拡張アンサンブル法による蛋白質の折れ畳みシミュレーション(第43回物性若手夏の学校(1998年度),講義ノート)
• モンテカルロシミュレーションによるタンパク質の立体構造予測
• モンテカルロシミュレーションで探るタンパク質の折り畳み機構
• 22pPSA-52 多次元拡張アンサンブル法の相転移がある系への応用(22pPSA 領域11ポスターセッション,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• タンパク質系分子シミュレーションのための力場関数(最近の研究から)
• 疎水コアとα-ヘリックスを含む小タンパク質のフォールディングシミュレーション
• タンパク質系分子シミュレーションのための力場関数
• 24pAA-8 第一原理シミュレーションにおける拡張アンサンブル法の提案 : 生体系における化学反応の理解に向けて(24pAA 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 19aPSB-9 二次元焼き戻し法のイジングモデルへの応用(19aPSB 領域11ポスターセッション,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 29pXZC-5 Simulated Tempering and Magnetizing法のPottsモデルへの応用(29pXZC 古典フラストレート系・古典スピン系一般,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 27aPS-82 小タンパク質の拡張アンサンブル方に基づくモンテカルロシミュレーション(27aPS 領域11,領域12合同ポスターセッション,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理分野))

もっと見る 閉じる

スポンサーリンク