環状イミド系化合物と protoporphyrinogen IX の分子形状類似性
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概要
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環状イミド系化合物は, クロロフィル生合成経路中の酵素であるprotoporphyrinogen IX oxidase (protox)を拮抗的に阻害する.そこで, 環状イミド系化合物とprotoxの基質であるprotoporphyrinogen IX (protogen)の形状類似性を評価するために, MOPACのPM3法を用いてこれらの化合物の安定構造を求め, 立体的特性を比較した.環状イミド系化合物は, イミド部とベンゼン環の二面角が240∿270°のときに安定であることが示唆された.そして, この両者の比較から環状イミド系化合物はprotogenのC, D環と重なり合った.また, C環の2-カルボキシエチル基はベンゼン環のメタ位の置換基と対応した.環状イミド系化合物とprotogenを最小二乗法により重ね合わせたときのshape similarity index (S)は, 0.62∿0.85の範囲であった.そして, Sとprotox阻害活性の間に良好な相関関係が得られた.この結果から, 阻害剤と基質の部分構造との分子の形状類似性はprotoxにおける分子認識に重要であることが示唆された.
- 日本農薬学会の論文
- 1997-11-20
著者
-
浦口 亮一
Graduate School of Agricultural Science, Tamagawa University
-
佐藤 幸治
Graduate School of Agricultural Science, Tamagawa University
-
BOGER Peter
Lehrstuhl fur Physiologie und Biochemie der Pflanzen, Universitat Konstanz
-
若林 攻
Graduate School of Agricultural Science, Tamagawa University
-
BOGER Peter
コンスタンツ大学
-
若林 攻
Graduate School Of Agricultural Science Tamagawa University
-
中山 章
Odawara Research Center Nippon Soda Co. Ltd.
-
佐藤 幸治
玉川大院・農
-
浦口 亮一
玉川大農化
-
Boger P.
Lehrstuhl Fur Physiologie Und Biochemie Der Pflanzen Universitat Konstanz
-
Boger Peter
Lehrstuhl Fur Physiologie Und Biochemie Der Pflanzen
-
中山 章
日本曹達小田原研
-
助川 正之
Odawara Research Center, Nippon Soda Co., Ltd.
-
岩滝 功
Odawara Research Center, Nippon Soda Co., Ltd.
-
助川 正之
Odawara Research Center Nippon Soda Co. Ltd.
-
岩滝 功
Odawara Research Center Nippon Soda Co. Ltd.
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