3PA028 プロリンcis-trans異性化における自由エネルギー地形

スポンサーリンク

概要

• 論文の詳細を見る
• 日本生物物理学会の論文
• 1999-09-02

著者

• 中村 春木

  阪大蛋白研

• 小野 聡

  三菱ウェルファーマ

• 中島 伸介

  阪大蛋白研

• 肥後 順一

  生物工研

• 小野 聡

  生物工研

• 中島 伸介

  三菱化学

関連論文

• 23aPS-86 新しい和の原理に基づく静電相互作用エネルギーの算出(23aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 特集にあたって (特集 蛋白質動的構造の新しいパラダイム)
• 30pTJ-5 マルチカノニカル法の並列化について(30pTJ 古典スピン系一般・量子スピン系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 29pVC-4 アルツハイマーβアミロイドペプチドの分子シミュレーション(29pVC 領域12,領域9合同シンポジウム:結晶成長とアミロイド病の物理学,領域9(表面・界面,結晶成長))
• 29pVC-4 アルツハイマーβアミロイドペプチドの分子シミュレーション(29pVC 領域12,領域9合同シンポジウム:結晶成長とアミロイド病の物理学,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 22aWB-9 アルファ/ベータ両方の二次構造要素を含む40残基蛋白質のフォールディングシミュレーション(22aWB 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 20aPS-125 マルチカノニカルMDシミュレーションによって描かれるdisordered protein(水中アミロイドβ12-36残基断片)の自由エネルギー地形(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 20aPS-124 蛋白質周辺における水分子の協調的挙動の分子動力学シミュレーションによる解析(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 20aPS-123 マルチカノニカル分子動力学法によるアミロイドペプチドの会合シミュレーション(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 2P008 アルファとベータの二次構造を含む40残基の蛋白質H-NSのfolding simulation(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 28pZG-6 タンパク質構造のダイナミクスを自由エネルギー地形から眺める
• 3P070ウシロドプシンの細胞質側第3ループの構造モデリング
• たんぱく質の立体構造に基づく物理情報学
• 1J1345 β-ヘアピンペプチドのフォールディングシミュレーション(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 1J1400 自由エネルギー地形からみたヘリカルペプチドのフォールディング・アンフォールディング機構(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• マルチカノニカルMD法から得られた小ペプチドのエネルギー地形とフォールディング機構(2000年度基礎物理学研究所研究会「モンテカルロ法の新展開2」,研究会報告)
• 1P028ヘリカルペプチドの水中におけるエネルギー地形
• 1P026エネルギー地形からみたβ-ヘアピンペプチドのフォールディング、アンフォールディング機構
• 3C1330 抗NP抗体B2のCDR-H3ループの真空中と水中における構造比較
• 3C1315 分子動力学によるβヘアピン形成
• 3A1615 multicanonical WHAM法によるドッキング・シミュレーション
• 1C0900 ペプチド自由エネルギー地形の量子化学計算による補正
• 2P060Tsallis統計の変数qを変動させる構造探索
• 多次元空間解析で迫る生体高分子の3次元立体構造とEnergetics(研究詳解) (特集 地図を描く・風景を眺める--主成分分析・多次元尺度法とその周辺)
• コンピュータシミュレーションで眺める生体高分子のエネルギー地形 (新世紀における蛋白質科学の進展) -- (第2部 蛋白質の構造・物性・進化)
• マルチカノニカル法によるタンパク質の自由エネルギー地形の解析(拡張アンサンブル,1998年度後期基礎物理学研究所研究会「モンテカルロ法の新展開」,研究会報告)
• 3PA028 プロリンcis-trans異性化における自由エネルギー地形
• 2PA036 マルチカノニカル・分子動力学法によるペプチド(10残基程度)の水中構造サンプリング
• ペプチド・ターン構造の自由エネルギー・プロファイル
• 構造探索法によるEGFレセプターのフラグメントペプチドの立体構造予測
• 27a-Q-3 構造サンプリングによるタンパク質構造形成の解析
• 3P39 マルチカノニカルMD法による抗体CDR-H3ループの構造探索
• 1U07 分子動力学による核酸結合蛋白質周囲の水の挙動の解析 2
• 1P39 選択的探索法によるあらわな水分子中ペプチドの効果的探索
• 1P292 立体構造に基づくタンパク質と糖鎖の分子間相互作用の分類と解析(生命情報科学 A) 構造ゲノミクス))
• 2PA064 EGFレセプターのフラグメントペプチドの立体構造予測と検証
• 分子シミュレーション計算における力場について
• 26pPSA-44 粗視化モデルと全原子モデルの連成計算(領域12ポスターセッション,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 30aPS-123 長距離相互作用を高速・高精度で行う新しい分子動力学法とその応用(30aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 2S1-6 統合DBのインパクトと将来への期待(2S1 動き出したライフサイエンス統合データベース,第46回日本生物物理学会年会)
• 20aPS-122 粗視化モデルを用いた全原子モデルの構造サンプリング効率化(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 25pPSB-43 MDにおける効率的静電相互作用計算(ポスターセッション,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 2P317 光合成反応中心スペシャルペアカチオンラジカルのスピン密度分布に関する理論的研究(光生物学(光合成・視覚と光受容),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P118 A Computational Study of Monoamine Oxidase A Dynamics(Membrane proteins,Poster Presentations)
• 1P045 タンパク質-リガンド複合体予測構造の分子シミュレーションによる評価(蛋白質(機能),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 24pPSB-38 拡張相空間における不変量と体積保存積分を用いた分子動力学法(24pPSB 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 3P116 Structural Fundamentals for Monoamine Oxidase A Inhibition Control Revealed by Molecular Dynamics Simulations
• Aquaporin1 channel proteins : Hybrid-QM/MM Computer Simulation
• 2SP6-01 序 : 原子構造から電子構造の解析へ(2SP6 生体高分子の電子構造解析 スーパーコンピューティングへ向けて,第47回日本生物物理学会年会)
• 抗体の進路経路の分岐(2)
• 抗体の進化経路の分岐(1)
• 27aP-1 マルチカノニカルWHAM法による活性化自由エネルギーの算出
• 22pPSA-23 厳密な体積保存積分法の構成と分子動力学方程式への適用(領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 1P078 Tsallis Dynamicsの構造サンプリング性能の検証(蛋白質 E) 計測・解析の方法論)
• 3SA03 蛋白質立体構造データベースの標準化と高度化(生物情報データベースの高度化・標準化)
• 14aPS-94 Tsallis 統計を利用した状態サンプリング手法の発展(ポスターセッション, 領域 11)
• 26pPSB-27 分子動力学方程式における新しい写像合成法による積分(26pPSB 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 22pZA-5 Tsallis 統計に基づく効率的サンプリングの検証
• 2SB06 構造情報からの機能類推 (構造ゲノム科学の展望)
• X線溶液散乱および分子動力学によるミオシンヘッドの構造変化
• 27aPS-20 Zero-dipole summation法の開発と分子系への適用(27aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 6pQC-10 Tsallis分布による効果的サンプリング手法(光物性・動力学,領域12)

もっと見る 閉じる

スポンサーリンク