30pTJ-5 マルチカノニカル法の並列化について(30pTJ 古典スピン系一般・量子スピン系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
- 2009-03-03
著者
関連論文
- 23aPS-86 新しい和の原理に基づく静電相互作用エネルギーの算出(23aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 特集にあたって (特集 蛋白質動的構造の新しいパラダイム)
- 3D0945 Simulated Annealing法によるPhotoactive Yellow ProteinのM中間体の解析(18.光生物(A)視覚,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)
- 30pTJ-5 マルチカノニカル法の並列化について(30pTJ 古典スピン系一般・量子スピン系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
- 29pVC-4 アルツハイマーβアミロイドペプチドの分子シミュレーション(29pVC 領域12,領域9合同シンポジウム:結晶成長とアミロイド病の物理学,領域9(表面・界面,結晶成長))
- 29pVC-4 アルツハイマーβアミロイドペプチドの分子シミュレーション(29pVC 領域12,領域9合同シンポジウム:結晶成長とアミロイド病の物理学,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 22aWB-9 アルファ/ベータ両方の二次構造要素を含む40残基蛋白質のフォールディングシミュレーション(22aWB 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 20aPS-125 マルチカノニカルMDシミュレーションによって描かれるdisordered protein(水中アミロイドβ12-36残基断片)の自由エネルギー地形(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 20aPS-124 蛋白質周辺における水分子の協調的挙動の分子動力学シミュレーションによる解析(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 20aPS-123 マルチカノニカル分子動力学法によるアミロイドペプチドの会合シミュレーション(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 2P008 アルファとベータの二次構造を含む40残基の蛋白質H-NSのfolding simulation(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 28pZG-6 タンパク質構造のダイナミクスを自由エネルギー地形から眺める
- たんぱく質の立体構造に基づく物理情報学
- 1J1345 β-ヘアピンペプチドのフォールディングシミュレーション(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
- 1J1400 自由エネルギー地形からみたヘリカルペプチドのフォールディング・アンフォールディング機構(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
- マルチカノニカルMD法から得られた小ペプチドのエネルギー地形とフォールディング機構(2000年度基礎物理学研究所研究会「モンテカルロ法の新展開2」,研究会報告)
- 1P028ヘリカルペプチドの水中におけるエネルギー地形
- 1P026エネルギー地形からみたβ-ヘアピンペプチドのフォールディング、アンフォールディング機構
- 3C1330 抗NP抗体B2のCDR-H3ループの真空中と水中における構造比較
- 3C1315 分子動力学によるβヘアピン形成
- 3A1615 multicanonical WHAM法によるドッキング・シミュレーション
- 1C0900 ペプチド自由エネルギー地形の量子化学計算による補正
- マルチカノニカル法によるタンパク質の自由エネルギー地形の解析(拡張アンサンブル,1998年度後期基礎物理学研究所研究会「モンテカルロ法の新展開」,研究会報告)
- 3PA028 プロリンcis-trans異性化における自由エネルギー地形
- 2PA036 マルチカノニカル・分子動力学法によるペプチド(10残基程度)の水中構造サンプリング
- ペプチド・ターン構造の自由エネルギー・プロファイル
- 構造探索法によるEGFレセプターのフラグメントペプチドの立体構造予測
- 27a-Q-3 構造サンプリングによるタンパク質構造形成の解析
- 3P39 マルチカノニカルMD法による抗体CDR-H3ループの構造探索
- 1U07 分子動力学による核酸結合蛋白質周囲の水の挙動の解析 2
- 1P292 立体構造に基づくタンパク質と糖鎖の分子間相互作用の分類と解析(生命情報科学 A) 構造ゲノミクス))
- 1E1445 Photoactive Yellow ProteinのpB中間体に対する分子動力学シミュレーション
- 2PA064 EGFレセプターのフラグメントペプチドの立体構造予測と検証
- 1P127分子シミュレーションによる水溶液中におけるPhotoactive Yellow Proteinの光反応中間体の構造解析
- 26pPSA-44 粗視化モデルと全原子モデルの連成計算(領域12ポスターセッション,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
- 30aPS-123 長距離相互作用を高速・高精度で行う新しい分子動力学法とその応用(30aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 2S1-6 統合DBのインパクトと将来への期待(2S1 動き出したライフサイエンス統合データベース,第46回日本生物物理学会年会)
- 20aPS-122 粗視化モデルを用いた全原子モデルの構造サンプリング効率化(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 25pPSB-43 MDにおける効率的静電相互作用計算(ポスターセッション,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
- 2P317 光合成反応中心スペシャルペアカチオンラジカルのスピン密度分布に関する理論的研究(光生物学(光合成・視覚と光受容),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 1P118 A Computational Study of Monoamine Oxidase A Dynamics(Membrane proteins,Poster Presentations)
- 1P045 タンパク質-リガンド複合体予測構造の分子シミュレーションによる評価(蛋白質(機能),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 24pPSB-38 拡張相空間における不変量と体積保存積分を用いた分子動力学法(24pPSB 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 3P116 Structural Fundamentals for Monoamine Oxidase A Inhibition Control Revealed by Molecular Dynamics Simulations
- Aquaporin1 channel proteins : Hybrid-QM/MM Computer Simulation
- 1P238 分子動力学計算によるロドプシンの基底状態および光反応中間体の動的構造(光生物 A) 視覚)
- 1P027 マルチカノニカルシミュレーションによって描かれる、水中のアルツハイマーβアミロイドペプチドAβ(12-36)の自由エネルギー地形(蛋白質(構造・構造機能相関),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 2P010 タンパク質中のセグメントが造る構造空間の解析(蛋白質 A) 構造))
- 2SP6-01 序 : 原子構造から電子構造の解析へ(2SP6 生体高分子の電子構造解析 スーパーコンピューティングへ向けて,第47回日本生物物理学会年会)
- 抗体の進路経路の分岐(2)
- 抗体の進化経路の分岐(1)
- 27aP-1 マルチカノニカルWHAM法による活性化自由エネルギーの算出
- 1P130分子動力学計算によるイ***ープロテインの基底状態および光反応中間体の動的構造
- 3P005 タンパク質の48残基セグメントのnative contactパターンの解析(蛋白質 A) 構造))
- 2P032 タンパク質から切り出した50残基のセグメントから眺めたフォールド空間(蛋白質 A) 構造)
- 1P011 マルチカノニカル分子動力学法による水中および30%TFE溶液中でのhumaninの自由エネルギー地形(蛋白質(構造・構造機能相関),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 1P255 分子動力学計算によるPhy3-LOV2の野生株と変異体の動的構造(光生物 A) 視覚・光受容))
- 2P266 分子動力学計算によるPhot-LOV2ドメインの基底状態と光反応中間体の動的構造(光生物 B) 光合成)
- 2P050 マルチカノニカル分子動力学シミュレーションによるPhotoactive Yellow ProteinのLからM中間体への変換経路に関する解析(蛋白質 A) 構造)
- 酵素-阻害剤のフレキシブルドッキング分子動力学シミュレーション
- 1P254 マルチカノニカル分子動力学計算によるPhotoactive Yellow ProteinのM中間体の構造解析(光生物 A) 視覚・光受容))
- 3P089 SH3ドメインの移状態で見られるエンタルピーバリア : 電荷ゼロ全原子モデルでのシミュレーション(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
- 2P031 タンパク質セグメント構造空間の探索(蛋白質 A) 構造)
- 静電相互作用を除いたMD法によるSH3domainの水中でのUnfoldingシミュレーション
- カメレオン配列の自由エネルギー地形
- マルチカノニカル動力学シミュレーションによるタンパク質構造解析
- 1J1415 カメレオンペプチドのエネルギー地形と構造2面性(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
- LS1A1 エネルギー地形とフォールディング機構 : 計算機による蛋白質フォールディング解明への試み(分子動力学シュミレーションで蛋白質の挙動を観察する,ランチョンセミナー,日本生物物理学会第40回年会)
- 22pPSA-23 厳密な体積保存積分法の構成と分子動力学方程式への適用(領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 1P078 Tsallis Dynamicsの構造サンプリング性能の検証(蛋白質 E) 計測・解析の方法論)
- 3SA03 蛋白質立体構造データベースの標準化と高度化(生物情報データベースの高度化・標準化)
- 14aPS-94 Tsallis 統計を利用した状態サンプリング手法の発展(ポスターセッション, 領域 11)
- 26pPSB-27 分子動力学方程式における新しい写像合成法による積分(26pPSB 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 30aSH-8 The role of DLCQ zero modo in spontaneous symmetry breaking
- 2p-C-10 DLCQによる有効作用の変分計算
- 20p-C-7 DLCQによる有効作用の変分計算
- 22pZA-5 Tsallis 統計に基づく効率的サンプリングの検証
- 2SB06 構造情報からの機能類推 (構造ゲノム科学の展望)
- X線溶液散乱および分子動力学によるミオシンヘッドの構造変化
- 27aPS-20 Zero-dipole summation法の開発と分子系への適用(27aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
- 6pQC-10 Tsallis分布による効果的サンプリング手法(光物性・動力学,領域12)