2P010 タンパク質中のセグメントが造る構造空間の解析(蛋白質 A) 構造))

スポンサーリンク

概要

• 論文の詳細を見る
• 日本生物物理学会の論文
• 2005-10-19

著者

• 肥後 順一

  東薬大・生命科学

• 富井 健太郎

  産総研・cbrc

• 広川 貴次

  産総研・CBRC

• 肥後 順一

  阪大meiセ

• 池田 和由

  産総研・CBRC

関連論文

• タンパク質立体構造予測の現状と未来
• CASP6会議報告 : 日本勢がんばる(談話室)
• 3D0945 Simulated Annealing法によるPhotoactive Yellow ProteinのM中間体の解析(18.光生物(A)視覚,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)
• 30pTJ-5 マルチカノニカル法の並列化について(30pTJ 古典スピン系一般・量子スピン系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 3P132 MD(分子動力学)シミュレーションを用いたダイポールフィールドの観測(細胞生物学的課題(接着・運動・骨格・伝達・膜)、水・水和、電解質,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 2P305 GPCRとGタンパク質の結合選択性予測(生命情報科学 B) 機能ゲノミクス))
• 29pVC-4 アルツハイマーβアミロイドペプチドの分子シミュレーション(29pVC 領域12,領域9合同シンポジウム:結晶成長とアミロイド病の物理学,領域9(表面・界面,結晶成長))
• 29pVC-4 アルツハイマーβアミロイドペプチドの分子シミュレーション(29pVC 領域12,領域9合同シンポジウム:結晶成長とアミロイド病の物理学,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 22aWB-9 アルファ/ベータ両方の二次構造要素を含む40残基蛋白質のフォールディングシミュレーション(22aWB 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 20aPS-125 マルチカノニカルMDシミュレーションによって描かれるdisordered protein(水中アミロイドβ12-36残基断片)の自由エネルギー地形(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 20aPS-124 蛋白質周辺における水分子の協調的挙動の分子動力学シミュレーションによる解析(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 20aPS-123 マルチカノニカル分子動力学法によるアミロイドペプチドの会合シミュレーション(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 2P008 アルファとベータの二次構造を含む40残基の蛋白質H-NSのfolding simulation(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 28pZG-6 タンパク質構造のダイナミクスを自由エネルギー地形から眺める
• たんぱく質の立体構造に基づく物理情報学
• 1J1345 β-ヘアピンペプチドのフォールディングシミュレーション(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 1J1400 自由エネルギー地形からみたヘリカルペプチドのフォールディング・アンフォールディング機構(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• マルチカノニカルMD法から得られた小ペプチドのエネルギー地形とフォールディング機構(2000年度基礎物理学研究所研究会「モンテカルロ法の新展開2」,研究会報告)
• 1P028ヘリカルペプチドの水中におけるエネルギー地形
• 1P026エネルギー地形からみたβ-ヘアピンペプチドのフォールディング、アンフォールディング機構
• 3C1330 抗NP抗体B2のCDR-H3ループの真空中と水中における構造比較
• 3C1315 分子動力学によるβヘアピン形成
• 3A1615 multicanonical WHAM法によるドッキング・シミュレーション
• 1E1445 Photoactive Yellow ProteinのpB中間体に対する分子動力学シミュレーション
• 3P078 分子動力学計算による水素結合場と低温X線結晶構造解析による結晶水の位置の相関(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
• 分子動力学法を用いた蛋白質水和構造における水素結合パターンの解析
• 1P127分子シミュレーションによる水溶液中におけるPhotoactive Yellow Proteinの光反応中間体の構造解析
• タンパク質セグメントが造る構造空間の解析
• 1P238 分子動力学計算によるロドプシンの基底状態および光反応中間体の動的構造(光生物 A) 視覚)
• 1P027 マルチカノニカルシミュレーションによって描かれる、水中のアルツハイマーβアミロイドペプチドAβ(12-36)の自由エネルギー地形(蛋白質(構造・構造機能相関),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P241 タンパク質立体構造予測パイプラインFORTE-SUITE向け網羅的モデリング・構造評価システム(生命情報科学(構造ゲノミクス),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• バイオインフォマティクスによる糖転移酵素遺伝子の発見 (特集 最先端創造科学研究の展望)
• 3P003 ロータマーを考慮した経験的ポテンシャルのタンパク質立体構造予測におけるモデル検証への適用(蛋白質 A) 構造))
• 2P010 タンパク質中のセグメントが造る構造空間の解析(蛋白質 A) 構造))
• 3P131 蛋白質周辺における水分子の流れ、分子動力学計算による解析(細胞生物学的課題(接着・運動・骨格・伝達・膜)、水・水和、電解質,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• タンパク質の構造空間の表示 : folding と docking を例に
• 3P273 CoLBA : 相互作用比較を考慮したリガンド結合予測法の開発(生命情報科学 A) 構造ゲノミクス)
• 1P130分子動力学計算によるイ***ープロテインの基底状態および光反応中間体の動的構造
• 3P005 タンパク質の48残基セグメントのnative contactパターンの解析(蛋白質 A) 構造))
• 2P032 タンパク質から切り出した50残基のセグメントから眺めたフォールド空間(蛋白質 A) 構造)
• 1P011 マルチカノニカル分子動力学法による水中および30%TFE溶液中でのhumaninの自由エネルギー地形(蛋白質(構造・構造機能相関),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P255 分子動力学計算によるPhy3-LOV2の野生株と変異体の動的構造(光生物 A) 視覚・光受容))
• 2P266 分子動力学計算によるPhot-LOV2ドメインの基底状態と光反応中間体の動的構造(光生物 B) 光合成)
• 2P050 マルチカノニカル分子動力学シミュレーションによるPhotoactive Yellow ProteinのLからM中間体への変換経路に関する解析(蛋白質 A) 構造)
• 酵素-阻害剤のフレキシブルドッキング分子動力学シミュレーション
• 1P254 マルチカノニカル分子動力学計算によるPhotoactive Yellow ProteinのM中間体の構造解析(光生物 A) 視覚・光受容))
• 3P089 SH3ドメインの移状態で見られるエンタルピーバリア : 電荷ゼロ全原子モデルでのシミュレーション(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
• 2P031 タンパク質セグメント構造空間の探索(蛋白質 A) 構造)
• 静電相互作用を除いたMD法によるSH3domainの水中でのUnfoldingシミュレーション
• カメレオン配列の自由エネルギー地形
• マルチカノニカル動力学シミュレーションによるタンパク質構造解析
• 1J1415 カメレオンペプチドのエネルギー地形と構造2面性(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• LS1A1 エネルギー地形とフォールディング機構 : 計算機による蛋白質フォールディング解明への試み(分子動力学シュミレーションで蛋白質の挙動を観察する,ランチョンセミナー,日本生物物理学会第40回年会)
• 1P174膜貫通ヘリックスを繋ぐループセグメントの解析
• 3P271 プロファイル構築法のタンパク質構造認識およびアラインメント精度に及ぼす影響(生命情報科学 A) 構造ゲノミクス)
• 新規構造認識法FORTE1 : その適用と限界

もっと見る 閉じる

スポンサーリンク