2P033酵素の機能部位置換と構造安定性

スポンサーリンク

概要

• 論文の詳細を見る
• 日本生物物理学会の論文
• 2001-09-10

著者

• 西川 建

  遺伝研

• 木下 賢吾

  東大医科研

• 太田 元規

  遺伝研

• 太田 元規

  東京工業大学学術国際情報センター

• 木下 賢吾

  横市大院・総合理学

関連論文

• 2P060 タンパク質AMP結合部位の構造多様性(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 2P036 X線結晶構造における生理学的接触と結晶学的接触の判別法の開発(蛋白質 B) 構造・機能相関))
• 静電ポテンシャルと分子表面形状による蛋白質のDNA結合能および結合部位の予測
• 1R1615 Orthologous遺伝子位置に基づくゲノム構造の巨視的比較-II : 極値分布による類似性評価とweb siteの構築(22.生命情報科学,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 1P233 代謝系における触媒ドメインを複数持つ酵素の位置づけ(生命情報科学(構造・機能・比較ゲノミクス),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 27aTH-10 Wang-Landau MDによるタンパク質の低エネルギー構造空間の効率的探索(27aTH 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 2P039 Wang-Landau MDを用いたタンパク質の構造空間探索(蛋白質 A) 構造)
• 30aWE-3 Wang Landau法を組み込んだマルチカノニカルMDの試み(生物理一般)(領域12)
• 好熱菌遺伝子の塩基組成の偏りとアミノ酸組成への影響
• タンパク質立体構造の高精度モデリングに向けて : 力場の改善
• タンパク質の天然構造近傍におけるレプリカ交換MD計算
• 29pZD-4 立体障害を緩和した MD シミュレーションによるタンパク質立体構造の最適化
• 1J0930 高精度モデリングによるタンパク質の立体構造予測(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 1R1600 好塩菌タンパク質のタンパク質表面における特徴とゲノムによる引きずり効果(22.生命情報科学,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 2PA062 エネルギー計算によって、タンパク質の正しいフォールドと誤ったフォールドを見分ける方法
• 蛋白質立体構造に対するパターン認識 : 全体の形状、局所構造、表面構造の分類と類似性検索
• 単体・複合体の立体構造変化の解析による分子認識機構解析
• 2PA025 分子置換法によるタンパク質晶解析のための初期モデルの構築
• 2P51 グロビンフォールドのde novo分子設計
• 3P010 Evolutionary Trace法と表面の相補性を利用したタンパク質相互作用様式予測法の開発(蛋白質 A) 構造))
• たんぱく質の立体構造に基づく物理情報学
• タンパク質フォールディング博物学の曙
• 蛋白質立体構造に対するパターン認識 : 全体の形状、局所構造、表面構造の分類と類似性検索
• 1P292 立体構造に基づくタンパク質と糖鎖の分子間相互作用の分類と解析(生命情報科学 A) 構造ゲノミクス))
• 3P272 蛋白質分子表面上の物理化学的性質、形状を用いた蛋白質問相互作用の予測法の開発(生命情報科学 A) 構造ゲノミクス)
• タンパク質分子表面形状と物性のデータベースeF-siteによる分子機能類似性検索
• 3H1045 蛋白質分子活性部位の表面形状と物性に関するデータベース(eF-site/ActiveSite)の構築
• 1D1045 タンパク質表面形状と物性に基づくリン酸結合部位の認識
• 3P095 祖先型と最近接現存種ミオグロビンの自動酸化反応の温度依存性(ヘム蛋白質,ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 3P087 最尤法により推測した祖先型ミオグロビンのアミノ酸配列(ヘム蛋白質))
• S3E05人工設計によるミオグロビン
• 2M1545 タンパク質主鎖構造の中立ネットワーク探査(20.生命の起源・進化,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 3PA033 人工グロビンの再設計 : 疎水性残基置換の効果
• 1L1030 人工Cro蛋白質のデザイン(1.蛋白質(F)蛋白質工学/進化工学,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 2P263 コレステロールの有無がもたらす膜環境の変化とアラメチシンに与える影響の分子動力学シミュレーション(生体膜・人工膜,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P239 確率的アライメントによるプロファイル : プロファイル法の性能向上(生命情報科学(構造ゲノミクス),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P283 タンパク質非相互作用部位データべースの構築と解析(生命情報科学 A) 構造ゲノミクス))
• 3P114 人工λCroの溶液構造(蛋白質 F) 蛋白質工学/進化工学)
• 3P003 ロータマーを考慮した経験的ポテンシャルのタンパク質立体構造予測におけるモデル検証への適用(蛋白質 A) 構造))
• 2P059 タンパク質間相互相互作用のインターフェイス解析のためのプロファイル比較(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P193遺伝子位置情報に基づいたゲノム比較 : I細菌ゲノム比較
• Superfamilyを超えた蛋白質構造の進化的類縁関係 : Fold-based superfamily
• CT3-1 スーパーコンピュータ・コンテスト2002(スーパーコンピュータ・コンテスト2002,学術系企画)
• 3K1045 データベースを利用したタンパク質の分子認識機構の解析(1.蛋白質(B)構造・機能相関,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)
• 2P035タンパク質の分子認識に伴う構造変化データベースの構築と解析
• 3PA104 糖結合タンパク質の基質結合部位の比較
• タンパク質局所構造の比較
• タンパク質立体構造と機能の関係 : 異なる2つのレベルでの構造の類似性と機能の類似性
• ペプチジルプロリルイソメラーゼの構造-機能相関--蛋白質の機能も,まずカタチから
• タンパク質の立体構造予測 : 結晶化しない酵素への応用
• 2P063 機能の異なる天然変性蛋白質の比較解析(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P250 sociableな蛋白質の相互作用面の解析(生命情報科学(構造ゲノミクス),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 1P005 ドメインサイズの残基出現頻度と埋もれやすさに与える影響(蛋白質(構造・構造機能相関),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• S12A4 蛋白質の配列・構造・機能相関の博物学(蛋白質の再発見によるゲノムから細胞に至る生物の統一的理解,シンポジウム,第45回日本生物物理学会年会)
• プロテインインフォマティクスによるタンパク質の機能推定
• 1P116 シャペロニンGroELの第2のATP結合部位の探索(蛋白質 D) 機能(反応機構、生物活性など)))
• 2SD01 最新の新規フォールド検出のためのPDB alertシステム(ストラクチュロームの地平線)
• タンパク質の表面物性の類似性に基づく機能予測
• データベースに依拠しない配列比較法の開発 : 微弱な配列類似性の検出を目指して
• 1P251 タンパク質ファミリー内に見られる会合状態の変化(生命情報科学(構造・機能・比較ゲノミクス),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 2P046 タンパク質ファミリー内での会合状態変化 : 相互作用面とアミノ酸置換(蛋白質 B) 構造・機能相関))
• 1P050 タンパク質会合状態の決定因子 : 配列、構造、機能からの考察(蛋白質 B) 構造・機能相関)
• 3H1100 糖結合蛋白質の基質結合部位の比較
• 1P185全ゲノム立体構造予測データベース"GTOP"の拡張
• 3H1400 全ゲノム立体構造予測データベース"GTOP"
• 2P062 フォールドする軌道としない軌道の決定因子 : Trpcageの場合(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
• 3P093 タンパク質のフォールディング軌道の系統樹が明らかにした天然構造へのパスウェイ(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
• TrpCageのフォールディング軌道
• 2PA063 推移確率スコアを用いたタンパク質の立体構造比較
• 変異確率行列を用いたタンパク質の立体構造比較
• 1P40 「タンパク質らしさ」を考慮したab initio構造予測の試み
• 1P232 微生物ゲノムから同定された必須マップに関する実現性の検証(生命情報科学(構造・機能・比較ゲノミクス),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• 最小細胞機能セットの探求
• λCroフォールドのデノボデザイン(トピックス)
• タンパク質フォールディングのバイオインフォマティクス (2005年のニュース総まとめ 特集:物理科学,この1年) -- (生物物理)
• 3P303 ミニマム代謝マップネットワークの探索(生命情報科学 C) 比較ゲノミクス))
• 2P011 タンパク質主鎖の局所構造-配列相関 : 1部位構造コードおよび統計的ポテンシャルによる解析(蛋白質 A) 構造))
• タンパク質のフォールディングシミュレーション(「ナノ, バイオテクノロジーにおける分子動力学シミュレーション」)
• 1P184遺伝子塩基組成のアミノ酸組成への影響
• 1I1100 2種マイコプラズマに見られるゲノム塩基組成の変異の方向性
• 2PA061 細胞内・外蛋白質のシス・プロリンの出現頻度
• 1P195コドン組成空間におけるゲノムの共通構造
• 3H1500 好熱菌タンパク質の分子表面におけるアミノ酸組成の特徴
• タンパク質の安定性と機能部位(理論編)
• あなたにも役立つバイオインフォマティクス(10)アミノ酸配列から立体構造を予測する
• あなたにも役立つバイオインフォマティクス(9)アミノ酸配列から2次構造を予測する
• 2P033酵素の機能部位置換と構造安定性
• 3G1315 DNA結合タンパク質λCROモチーフのデノボ設計と合成
• 1SF06 インバース・フォールディング的フォールディング問題 (タンパク質のフォールディング問題 : 立体構造予測から分子病理まで)
• Ab-initio threadingの提案
• 1P085 新規プロリン異性化酵素の創製(蛋白質(蛋白質工学・進化工学)、核酸結合蛋白質、核酸,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
• タンパク質間相互作用に関与するデータベースの構築 (タンパク質間相互作用)
• 2P037モノヌクレオチド結合タンパク質の分子認識における構造変化と水和構造
• 2P036モノヌクレオチド結合タンパク質データベースの構築と構造機能相関の解析
• 3P43 蛋白質立体構造の比較による単位構造の同定
• 1J1045 βタンパク質フォールド間における共通構造(1.蛋白質(A)構造,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 3K1030 モノヌクレオチド結合タンパク質データベースの構築と構造機能相関の解析(1.蛋白質(B)構造・機能相関,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)
• 分子表面の形状と静電ポテンシャルの類似性検索による蛋白質の機能推定
• 立体構造に基づいたタンパク質の機能予測 : 機能予測(ゲノム情報科学の新展開 : 生物物理の立場から)

もっと見る 閉じる

スポンサーリンク