3D-1D法の可能性
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
Essential ideas in the protein 3D-1D compatibility analysis are briefly introduced. The 3D-1D alignment was revolutionary in the establishment of the methodology. The method is applicable for structure prediction, stability evaluation of point mutants, deducing functional sites etc. In these applications it appears free of the protein folding problem, however, this is not the case if we try to design de-novo sequence.
- 日本生物物理学会の論文
- 1998-05-25
著者
関連論文
- 1P233 代謝系における触媒ドメインを複数持つ酵素の位置づけ(生命情報科学(構造・機能・比較ゲノミクス),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 2P51 グロビンフォールドのde novo分子設計
- タンパク質フォールディング博物学の曙
- 3P095 祖先型と最近接現存種ミオグロビンの自動酸化反応の温度依存性(ヘム蛋白質,ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 3P087 最尤法により推測した祖先型ミオグロビンのアミノ酸配列(ヘム蛋白質))
- S3E05人工設計によるミオグロビン
- 2M1545 タンパク質主鎖構造の中立ネットワーク探査(20.生命の起源・進化,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
- 3PA033 人工グロビンの再設計 : 疎水性残基置換の効果
- 1L1030 人工Cro蛋白質のデザイン(1.蛋白質(F)蛋白質工学/進化工学,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
- 1P239 確率的アライメントによるプロファイル : プロファイル法の性能向上(生命情報科学(構造ゲノミクス),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 3P114 人工λCroの溶液構造(蛋白質 F) 蛋白質工学/進化工学)
- 3P003 ロータマーを考慮した経験的ポテンシャルのタンパク質立体構造予測におけるモデル検証への適用(蛋白質 A) 構造))
- 2P059 タンパク質間相互相互作用のインターフェイス解析のためのプロファイル比較(蛋白質(構造・構造機能相関),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
- CT3-1 スーパーコンピュータ・コンテスト2002(スーパーコンピュータ・コンテスト2002,学術系企画)
- タンパク質の立体構造予測 : 結晶化しない酵素への応用
- 2SD01 最新の新規フォールド検出のためのPDB alertシステム(ストラクチュロームの地平線)
- 1P251 タンパク質ファミリー内に見られる会合状態の変化(生命情報科学(構造・機能・比較ゲノミクス),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 2P046 タンパク質ファミリー内での会合状態変化 : 相互作用面とアミノ酸置換(蛋白質 B) 構造・機能相関))
- 1P050 タンパク質会合状態の決定因子 : 配列、構造、機能からの考察(蛋白質 B) 構造・機能相関)
- 1P185全ゲノム立体構造予測データベース"GTOP"の拡張
- 3H1400 全ゲノム立体構造予測データベース"GTOP"
- 2P062 フォールドする軌道としない軌道の決定因子 : Trpcageの場合(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
- 3P093 タンパク質のフォールディング軌道の系統樹が明らかにした天然構造へのパスウェイ(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)
- TrpCageのフォールディング軌道
- 1P232 微生物ゲノムから同定された必須マップに関する実現性の検証(生命情報科学(構造・機能・比較ゲノミクス),口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)
- 最小細胞機能セットの探求
- λCroフォールドのデノボデザイン(トピックス)
- タンパク質フォールディングのバイオインフォマティクス (2005年のニュース総まとめ 特集:物理科学,この1年) -- (生物物理)
- 3P303 ミニマム代謝マップネットワークの探索(生命情報科学 C) 比較ゲノミクス))
- 2P011 タンパク質主鎖の局所構造-配列相関 : 1部位構造コードおよび統計的ポテンシャルによる解析(蛋白質 A) 構造))
- タンパク質のフォールディングシミュレーション(「ナノ, バイオテクノロジーにおける分子動力学シミュレーション」)
- タンパク質の安定性と機能部位(理論編)
- あなたにも役立つバイオインフォマティクス(10)アミノ酸配列から立体構造を予測する
- あなたにも役立つバイオインフォマティクス(9)アミノ酸配列から2次構造を予測する
- 2P033酵素の機能部位置換と構造安定性
- 3G1315 DNA結合タンパク質λCROモチーフのデノボ設計と合成
- 1SF06 インバース・フォールディング的フォールディング問題 (タンパク質のフォールディング問題 : 立体構造予測から分子病理まで)
- Ab-initio threadingの提案
- 3D-1D法の可能性
- 3P50 グロビン保存残基は構造的(または機能的)要請の結果か?
- 1SB-05 ミニマム細胞の設計原理 : 比較ゲノムからのアプローチ(1SB 生命の設計原理を問う,日本生物物理学会第49回年会(2011年度))