Using Linkage Map of Mouse for Prediction of Gene Location in Animals
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概要
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The high-density linkage map of mouse has been constructed. This map contains quantitative trait loci (QTL) and major genes which are not mapped on other animals. In this study, a Bayesian model was developed to predict the chromosome number of unmapped genes in animals using comparative mapping data in contrast with mouse linkage map. The comparative mapping data of mouse-human, mouse-rat and mouse-cattle is collected from the Animal Genome Database. In order to examinethe accuracy of our method, we randomly divided the data into two subsets. The ratios of chromosomal translocation of mouse-human, mouse-rat and mouse-cattle were estimated by one of the subsets, and the chromosome numbers of mapped genes of human, rat and cattle were predicted for another subset.
- 日本計量生物学会の論文
著者
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柏木 宣久
統計数理研究所
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岸野 洋久
東京大学大学院 総合文化研究科
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和田 康彦
農林水産省畜産試験場育種部家畜ゲノム研究チーム
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和田 康彦
農林水産省畜産試験場
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岸野 洋久
東京大学大学院農学生命科学研究科生物測定学研究室
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柏木 宣久
統計数理研究所調査実験解析研究系
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