好酸性細菌Acidocella facilis 22Mの制限修飾系遺伝子のクローニングと塩基配列決定

スポンサーリンク

概要

• 論文の詳細を見る

• CGATCGを認識する Afa22MI 制限修飾系遺伝子を好酸性細菌 Acidocella facilis 22M より、クローニングし、塩基配列を決定した。その結果、C5-シトシンメチラーゼに特徴的なモチーフが保存された。M.Afa22MI 遺伝子、その上流に、M.Afa22MI 遺伝子とは逆方向に、 very short patch repair endonuclease 様タンパク質遺伝子（Afa22MI vsr）、制限酵素（R.Afa22MI）遺伝子と推定されるオープンリーディングフレームが見出された。M.Afa22MI の推定アミノ酸配列は、Xanthomonas oryzae pv. oryzae 由来 M.XorII の配列と全体で約63%、veriable region 内で約53%の高い配列類似性を示した。また、Afa22MI usr の推定アミノ酸配列も、M.XorIIに付随する XorII vsr の配列と約66%の高い類似性を示した。The gene encoding the Afa22MI restriction-modification system recognizing the sequence 5'-CGATCG-3' was cloned from Acidocella facilis 22M and sequenced. The cloned DNA fragment contained three genes encoding the Afa22MI methylase (M.Afa22MI) , the putative restriction endonuclease Afa22MI (R.Afa22MI) and a very short patch repair endonuclease (Afa22MI vsr) . M. Afa22MI gene has the conserved motifs of C5-cytosine methyltransferase. Afa22MI vsr gene was localized upstream of M. Afa22MI gene in opposite orientation, and an open reading frame of R. Afa22MI has about 53% sequence similarity to the amino acid sequence for the variable region of M.XorⅡ. Afa22MI vsr has about 66% sequence similarity to the amino acid sequence of XorII vsr which was associated M. XorII.

• 岡山大学農学部の論文

著者

• 田村 隆

  岡山大院・自然科学

関連論文

• 9.高基質特異性L-アミノ酸オキシダーゼの基質認識機構の解析(第419回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会)
• 2-IV-28 放射性同位元素^Cuを用いたBacillus sbutilis 168の銅代謝解析(一般演題,日本ビタミン学会第62回大会発表要旨)
• 2-IV-30 キイロショウジョウバエ由来チオレドキシン還元酵素のレドックス機能解析(一般演題,日本ビタミン学会第62回大会発表要旨)
• 2-IV-29 セレノリン酸合成酵素SPS1はSPS2を抑制する(一般演題,日本ビタミン学会第62回大会発表要旨)
• 7.中性脂肪測定用酵素グリセロールキナーゼの構造特性解析と耐熱化(第417回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会)
• 1-III-6 Pseudomonas putida由来L-メチオニン γ-リアーゼの活性中心残基への変異導入による基質特異性の改変(一般演題,日本ビタミン学会第62回大会発表要旨)
• 海産性好熱性細菌 Rhodothermus marinus 由来イソアミラーゼの精製，性質検討及びＸ線結晶構造解析
• 2-III-13 放線菌由来L-グルタミン酸オキシダーゼ : クローニング,発現,及び諸性質検討
• 1P036 結晶構造と量子化学計算に基づく細菌NAD依存型イソクエン酸脱水素酵素の反応機構(蛋白質 B) 構造・機能相関))
• 1.放線菌Streptomyces avermitilis由来L-メチオニンγ-リアーゼの精製と性質(第413回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会)
• 1C11-3 抗腫瘍性酵素L-メチオニンγ-リアーゼの変異酵素C49Kの作製及び性質検討(酵素学・酵素工学・タンパク質工学,一般講演)
• 1F10-2 放線菌Streptomyces avermitilis由来L-メチオニンγリアーゼの精製と性質検討(酵素学,酵素工学,タンパク質工学,一般講演)
• 8.抗腫瘍性B_6酵素L-メチオニンγ-リアーゼにおけるCys116の役割(第398回ビタミンB研究委員会研究発表要旨)
• 2A11-4 DsbAコンビナトリアル変異ライブラリーの酸化還元電位評価(酵素学・酵素工学・タンパク質工学,一般講演)
• 2-II-26 超好熱好酸性古細菌Sulfolobus tokodaii由来シスタチオニンγ-シンターゼの精製および性質検討(第56回大会一般研究発表)
• Semiempirical Molecular Orbital Calculation for the Redox Property of C-Terminal Active Site　Sequence of Human Thioredoxin Reductase
• 1.シネフンギン生合成酵素の遺伝子クローニング
• 抗がん酵素L-Methionine γ-lyaseの精密立体構造
• UV照射とプロトプラスト再生法によるStreptomyces incarnatusのリファンピシン耐性とシネフンギン生産性の向上(英文)
• Selenium for Cancer Prevention and Human Health
• 709 放線菌由来L-グルタミン酸オキシダーゼを利用したL一GluセンサーとGOT・GPTセンシングへの応用
• 116 19F-nmrを用いるモノフルオロ酢酸生産のCosynthesis実験
• 2-III-17 硫黄酸化細菌Thiobacillus thiooxidans由来イソクエン酸脱水素酵素と同遺伝子の解析
• 2-III-15 ヒト肺がん細胞由来のチオレドキシン還元酵素遺伝子の点突然変異
• 2. Pseudomonas putida L-Methionine γ-lyaseのTyrosine114の役割
• 211 NAD^+:penicillamine ADP transferase高生産性Bacillus sphaericusの作成
• 1-II-9 L-メチオニンγ-リアーゼの立体構造
• 1. Thiobacillus thiooxidansのイソクエン酸脱水素酵素の性質と遺伝子クローニング
• 2-B-13 NAD依存型イソクエン酸脱水素酵素の量子酵素化学(第57回大会一般研究発表)(第57回大会研究発表要旨)
• 722 好酸性細菌Acidobacterium capsulatum由来のキシラナーゼの精製及び諸性質の検討
• 3P-1075 Trichoderma viride由来抗腫瘍性酵素L-リシンα-オキシダーゼの精製と結晶化(2a酵素学,酵素工学,一般講演,酵素学,タンパク質工学および酵素工学,伝統の技と先端科学技術の融合)
• 2P-1053 ジスルフィドイソメラーゼの酸化還元電位を持つDsbA[CRIC]の発現系検討(2a酸素学,酵素工学,一般講演,酵素学,タンパク質工学および酵素工学,伝統の技と先端科学技術の融合)
• 1-II-6 抗腫瘍性酵素L-methionine γ-lyaseの活性中心におけるAsp241の機能解析(一般研究発表,日本ビタミン学会 第58回大会研究発表要旨)
• Pseudomonas putida のL-メチオニン分解系オペロンの解析
• 1-II-7 Pseudomonas putidaのメチオニン誘導性の新規α-ケト酪酸脱水素酵素E1について : 第49回大会一般研究発表要旨
• Pseudomonas putidaのα-ケト酪酸デヒドロゲナーゼE1成分の大腸菌内での発現と諸性質
• Pseudomonas putidaのL-メチオニン分解系オペロンの転写調節因子の解析 : 微生物
• 1C11-4 L-グルタミン酸オキシダーゼの立体構造と機能の相関解析(酵素学・酵素工学・タンパク質工学,一般講演)
• 2C13-5 放線菌由来のバイオセンサー用酵素L-グルタミン酸オキシダーゼの大腸菌での精製系確立とX線結晶構造解析(酵素学・酵素工学・タンパク質工学,一般講演)
• 2-II-24 放線菌由来L-グルタミン酸オキシダーゼの構造特性と基質認識機構の解析(一般研究発表,日本ビタミン学会第61回大会研究発表要旨)
• 2Fa07 糸状菌Trichoderma viride由来の抗腫瘍性酵素L-リジンα-オキシダーゼ : 遺伝子の単離と解析(酵素学,酵素工学,タンパク質工学,一般講演)
• 2Dp12 新規耐熱性アミダーゼの遺伝子クローニングと酵素精製(酵素学・酵素工学,一般講演)
• 1Bp22 rpoB遺伝子改変によるStreptomyces incarnatusのシネフンギン高生産株(遺伝子工学,一般講演)
• 5.ペニシラミンの微生物代謝の酵素化学 : NADの新しい生理機能 : ビタミンB研究委員会第357回会議研究発表要旨
• 2-III-4 ADP-penicillamine合成酵素の精製と反応生成物の同定 : 第49回大会一般研究発表要旨
• 1-II-5 抗腫瘍性酵素L-リジンα-オキシダーゼの遺伝子クローニング(ビタミン学の原点・栄養学への21世紀的回帰, 日本ビタミン学会第59回大会)
• 2-III-25 放線菌由来L-グルタミン酸オキシダーゼの大腸菌での大量精製系の確立(一般研究発表,日本ビタミン学会 第58回大会研究発表要旨)
• 2-I-16 亜セレン酸の還元代謝に関わるセレン-Thioredoxin付加体の同定(一般研究発表,日本ビタミン学会第61回大会研究発表要旨)
• 亜セレン酸還元代謝の「定説」を疑う!!
• 2-IV-16 ヒト肺由来セレノリン酸合成酵素アイソザイムのドメイン機能解析(一般研究発表,新世紀ビタミン学の展望と先進的展開を目指して,日本ビタミン学会第60回大会発表要旨)
• 2-III-14 大腸菌の亜セレン酸同化はチオレドキシン還元酵素に依存する(一般研究発表,日本ビタミン学会 第58回大会研究発表要旨)
• 2Dp06 新規な活性中心配列を持つDsbA[CDIC]のジスルフィドイソメラーゼ活性(酵素学・酵素工学,一般講演)
• 1Fp11 祖先型変異導入によるグリセロールキナーゼの耐熱化(酵素学,酵素工学,タンパク質工学,一般講演)
• 2-IV-14 Drosophila TrxRのC末端レドックスモチーフの同定(一般研究発表,新世紀ビタミン学の展望と先進的展開を目指して,日本ビタミン学会第60回大会発表要旨)
• 2-III-26 好熱好酸性アーキアSulfolobus tokodaii strain 7由来シスタチオニンγシンターゼの機能解析(一般研究発表,新世紀ビタミン学の展望と先進的展開を目指して,日本ビタミン学会第60回大会発表要旨)
• 臨床診断・生化学検査に貢献する酵素の構造と機能解析(バイオテクノロジーへの応用的戦略を踏まえたタンパク質構造解析)
• 3.好熱好酸性古細菌Sulfolobus tokodaii由来シスタチオニンγ-シンターゼ(第410回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会)
• 2S3PM5 臨床診断・生化学検査に貢献する酵素の構造と機能解析(バイオテクノロジーへの応用的戦略を踏まえたタンパク質構造解析,シンポジウム)
• 2B09-2 超好熱好酸性古細菌Sulfolobus tokodaii strain 7由来ホモセリンキナーゼの大腸菌での発現と性質検討(酵素学・酵素工学・タンパク質工学,一般講演)
• 3. Cellulomonas属細菌由来のグリセロールキナーゼの特性と立体構造解析(第407回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会)
• 2-II-7 Q494R型チオレドキシン還元酵素の基質特異性(ビタミン学の原点・栄養学への21世紀的回帰, 日本ビタミン学会第59回大会)
• 2-II-6 分子軌道計算に基づくTrxRの精密分子設計とアレニウスプロット解析(ビタミン学の原点・栄養学への21世紀的回帰, 日本ビタミン学会第59回大会)
• The C-Terminal Tetrapeptide Sequence of Drosophila Thioredoxin Reductase Does not Function as a Redox-active Motif in the Human Lung Counterpart
• 16.硫黄酸化細菌A.thiooxidansのNAD^+依存型イソクエン酸脱水素酵素(ビタミンB研究委員会第399回研究協議会研究発表要旨)
• 好酸性細菌Acidocella facilis 22Mの制限修飾系遺伝子のクローニングと塩基配列決定
• L-グルタミン酸オクシターゼを用いたグルタミン酸センサーの開発及びGOT/GPTセンシングヘノ応用
• 好酸性細菌Acidocella facilis由来菌対外酸性エステラーゼ遺伝子のクローニング(和文)
• Streptomyces sp. X-119-6由来L-グルタミン酸オキシダーゼのクローニング及び発現
• 好酸性細菌 Acidiphilium organovorum 由来のアラニンラセマーゼ(英文)
• ゴ-ルドラッシュ時代を迎えたセレンの生化学研究 (特集 最近の生命科学)
• ヒト肺腫瘍細胞に高発現するセレン酵素, チオレドキシン還元酵素の諸性質
• Thiobacillus thioo xidansのイソクエン酸脱水素酵素 -精製と性質-
• Thiobacillus thioo xidans の3-イソプロピルリンゴ酸脱水素酵素-精製と性質-
• 新規セレン酵素,チオレドキシン還元酵素の精製と諸性質 : 動物
• Bacillus属由来ペニシラミン分解酵素の反応生成物の同定 : 酵素
• セレノシステイン含有ペプチドの合成と生化学的機能の研究
• 2-IV-9 好熱好酸性アーキアSulfolobus tokodaii由来シスタチオニンγ-シンターゼのPhe97残基の機能解析(一般演題要旨,日本ビタミン学会第63回大会講演要旨)
• 2-I-28 ヒト由来セレノシステインβリアーゼ遺伝子の発現系構築と機能解析(一般演題要旨,日本ビタミン学会第63回大会講演要旨)
• 9.ヒト由来セレノシステインβ-リアーゼ様タンパク質の発現,活性確認と機能解析(第423回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会)
• 1.L-メチオニンγ-リアーゼC116H変異酵素の構造と機能の解析(第424回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会)
• 3Ea13 ジスルフィドイソメラーゼの酸化還元電位を持つDsbAの活性測定(タンパク質工学/脂質工学,一般講演)
• 2Dp21 Thermus sp. O-3-1由来耐熱性アミダーゼの構造解析と含有金属分析(酵素学・酵素工学,一般講演)
• 2-V-16 セレノリン酸合成酵素SPS1/SPS2の相互作用(一般演題要旨,日本ビタミン学会第64回大会講演要旨)
• シネフンギン生産菌Streptomyces incarnatus NRRL8089由来アルギニン変換化合物「オルニチンラクタム」の同定
• 6. L-グルタミン酸オキシダーゼより作成したL-ヒスチジンオキシダーゼの構造解析とL-アルギニンオキシダーゼの特性解析(第430回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会)
• 2-II-11 共役法によるセレノリン酸合成酵素の機能解析(一般演題要旨,第65回大会講演要旨)
• 1-III-4 Trichoderma viride由来抗腫瘍性酵素L-Lysine α-oxidaseのX線結晶構造(一般演題要旨,第65回大会講演要旨)
• 3Cp04 高基質特異性L-グルタミン酸オキシダーゼの基質認識機構の解析及び基質特異性改変酵素の性質検討(酵素学,酵素工学,一般講演)
• 2Dp10 系統樹解析と分子モデリングに基づく[NiFeSe]型ヒドロゲナーゼの分子進化解析(分類,系統,遺伝学/遺伝子工学/植物細胞工学,組織培養,育種工学,一般講演)
• 6. 抗腫瘍性酵素L-リシンα-オキシダーゼのX線結晶構造解析(第432回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会)

もっと見る 閉じる

スポンサーリンク