複雑な多谷ポテンシャルエネルギー面上で生起する動力学諸問題 : タンパク質とその周辺(研究会報告)

スポンサーリンク

概要

• 論文の詳細を見る

• この論文は国立情報学研究所の電子図書館事業により電子化されました。研究会報告

• 物性研究刊行会の論文
• 2006-04-20

著者

• 小松崎 民樹

  北大電子研

• 戸田 幹人

  奈良女子大学理学部物理科学科

• 戸田 幹人

  奈良女理

• 戸田 幹人

  奈良女子大学理学部

• 渕上 壮太郎

  横浜市立大学 国際総合科学研究科

• 小松崎 民樹

  神戸大学 理学部

• 戸田 幹人

  奈良女子大学 理学部 物理科学科

• 戸田 幹人

  奈良女子大学

関連論文

• タンパク質の構造・運動とその進化(タンパク質構造と進化と情報幾何) (離散力学系の分子細胞生物学への応用数理)
• 21pPSB-68 粘菌の自己組織化的な環境適応モデルのダイナミクス(21pPSB 領域11ポスターセッション,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 21aEF-7 たんぱく質分子の分子動力学による時系列解析ver4(21aEF 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 21pPSB-56 Liouville方程式を用いた遷移動力学の集団挙動とカオス(21pPSB 領域11ポスターセッション,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• タンパク質立体構造における時系列特徴抽出
• 23aPS-132 複雑ネットワークから階層的なツリー構造(disconnectivity graph)を構成する方法論に関する一考察(23aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 27aQE-13 たんぱく質分子の分子動力学による時系列解析ver3(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• タンパク質エネルギー地形における構造多様性と多次元エネルギー地形の新しい可視化手法(複雑な多谷ポテンシャルエネルギー面上で生起する動力学諸問題-タンパク質とその周辺-,研究会報告)
• 31aPS-87 タンパク質フォールディングにおけるダイナミックス解析 : 非定常性・非マルコフ性ヘリックス・シート構造の相関
• 3P-066 機械受容イオンチャネルの統計的解析 : ゲーティング機構の理解に向けて(蛋白質・計測,解析の方法論,第46回日本生物物理学会年会)
• 23aPS-88 多変数確率過程の背後に存在する集団運動の数理(23aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 1S7-5 1分子計測から読み解く状態遷移ネットワーク : 機械受容チャネルを例に(1S7 イオンチャネルゲーティングのダイナミクスをイメージする,第46回日本生物物理学会年会)
• 22pWB-6 1分子時系列情報から読み解く生命機能の階層構造(22pWB 領域12シンポジウム:単一分子分光の最前線,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 高分子とカオス : 異常拡散と階層的規則性
• 22pTJ-4 反応過程のミニマルハミルトニアンにおける巾的挙動(領域11,領域12合同シンポジウム:反応過程における巾的揺らぎの起源とその可能性,領域11,統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)
• 22pTJ-7 時系列から見る運動の階層性(領域11,領域12合同シンポジウム:反応過程における巾的揺らぎの起源とその可能性,領域11,統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)
• 19aTC-10 タンパク質の階層的ダイナミックスにおける多様な時空間スケールでの協同現象(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 19pTC-3 生体分子の構造変化における周囲の水の動態場に観測される流体力学的構造(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 21aWA-9 イプシロンマシンによる因果構造解析 : 力学系理論の立場から(情報統計力学,領域11,統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)
• 25aXF-5 HCNCNH異性化反応の非エルゴード性2(25aXF 保存系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 23pRC-9 測定値の分布形状に基づく一分子時系列解析法 : 局所エルゴード状態の推定と自由エネルギー面の再構築(23pRC 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 水の場としての集団運動と生体分子の構造転移ダイナミクス(複雑な多谷ポテンシャルエネルギー面上で生起する動力学諸問題-タンパク質とその周辺-,研究会報告)
• Geometrical Structure buried in the Phase Space of Stochastic Structural Transition(複雑な多谷ポテンシャルエネルギー面上で生起する動力学諸問題-タンパク質とその周辺-,研究会報告)
• 複雑な多谷ポテンシャルエネルギー面上で生起する動力学諸問題 : タンパク質とその周辺(研究会報告)
• 27pXE-12 HCNの異性化反応の非エルゴード性(27pXE 力学系(保存系),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 27aTH-7 1分子時系列情報から構成される状態空間構造 : 反応遷移ネットワーク構造(27aTH 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 23aTG-9 ポルフィリンにおけるエネルギー移動現象の量子ダイナミクスによる研究とその古典解析(23aTG 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• タンパク質立体構造の動きに着目した時系列解析
• タンパク質立体構造の動きに着目した時系列解析
• 30aPS-125 たんぱく質分子の分子動力学による時系列解析(30aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 20aPS-120 たんぱく質分子の分子動力学による時系列解析(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 領域11,12「反応過程における巾的揺らぎの起源とその可能性」(第62回年次大会シンポジウムの報告)
• 22pTJ-1 はじめに(領域11,領域12合同シンポジウム:反応過程における巾的揺らぎの起源とその可能性,領域11,統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)
• 24pPSB-27 生体分子の運動における縮訳可能性(24pPSB 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 1SD06 多自由度状態空間におけるタンパク質の分子機能に関する動力学的な起源(大自由度力学系としてみる蛋白質系の動力学構造)(English Session)
• 22pXE-7 反応性軌道の時系列解析(力学系(保存系),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 22aPS-17 funnel型ポテンシャルに基づく分子機械のモデル(領域11ポスターセッション,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 20pXL-2 ストラテジーを持ったディーラー集団における記憶の長さの効果(経済物理(エージェント,企業のモデル),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 19aPS-90 ストラテジーを持つディーラーからなる人工市場の統計的性質(領域11ポスターセッション,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 高励起振動状態の分子のダイナミックスとカオス(3)分子科学、核理論における量子カオスと半古典理論,京大基研短期研究会 量子力学とカオス-基礎的問題からナノサイエンスまで-,研究会報告)
• 高励起振動状態の分子のダイナミックスとカオス(2)分子科学、核理論における量子カオスと半古典理論,量子力学とカオス-基礎的問題からナノサイエンスまで-,研究会報告)
• 28pYN-5 ディコヒーレンスの量子カオス
• 量子カオスにおける位相回復 (複雑系の科学--その理論的パラダイムを求めて)
• Study of Magnetic Excitation in Singlet-Ground-State Magnets CsFeCl_3 and RbFeCl_3 by Nuclear Magnetic Relaxation
• Neutron Diffraction Study of Field-Induced-Order in Singlet-Ground-State Magnet CsFeCl3 (Proceedings of the 1st International Symposium on Advanced Science Research(ASR-2000), Advances in Neutron Scattering Research)
• Softening Effect of Magnetic Excitation on Nuclear Spin-Lattice Relaxation of ^Cs in Singlet-Ground-State Magnet CeFeCl_3
• 22aWA-8 量子絡み合いに現れる複雑さの普遍性(量子エレクトロニクス(量子情報),領域1(原子・分子,量子エレクトロニクス,放射線物理))
• 量子カオスとζ関数
• 23aTG-6 タンパク質分子の分子動力学に対する時系列解析V(23aTG 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 多自由度化学反応系における再交差(recrossing)運動の近可積分性に関する研究(力学系と複雑性,基研長期研究会「複雑系4」)
• 19aPS-87 量子カオス系の制御をめざして(領域11ポスターセッション,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 27pYC-6 Arnold web 上の運動の時系列解析(力学系(保存系)・回転と波動,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 27pYC-5 funnel型ポテンシャルをもつハミルトン系の挙動(力学系(保存系)・回転と波動,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 24pYF-1 戦略を持つディーラーモデルの考察(経済物理,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 14aPS-54 資産分布を取り入れた株価変動のモテル(ポスターセッション, 領域 11)
• 14aPS-26 大自由度カオス系の非定常性, エルゴード性について(ポスターセッション, 領域 11)
• 28pWA-10 量子エンタングルメントに潜む古典動力学性(量子カオス系)(領域11)
• 29pZD-3 蛋白質フォールディングの粗視化されたスケールで現れるコヒーレンス
• 力学系の立場から化学反応論を考える : 「現象と応用」 (近可積分ハミルトン系の数理と応用)
• ファネル談義 : なぜ蛋白質は一義的に効率よく折り畳むのでしょうかね?
• 化学反応の動力学とカオス(複雑な多谷ポテンシャルエネルギー面上で生起する動力学的諸問題-力学的決定性と統計性の中間領域を探る(第2回)-,研究会報告)
• 高励起振動状態におけるアーノルドの編みの目(第8回「非平衡系の統計物理」シンポジウム,研究会報告)
• 化学反応の動力学とカオス
• 高励起振動状態におけるアーノルドの編みの目(1998年度後期 基礎物理学研究所研究会「非平衡非定常ダイナミクスの解明-新しい化学反応論を目指して-」,研究会報告)
• 3P028 離散ウェーブレット変換を用いた一分子時系列における動力学の階層性の解析(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
• 3P-082 機械受容型イオンチャネルダイナミクスの統計的解析(膜蛋白質,第47回日本生物物理学会年会)
• 22pEC-12 溶質分子の構造変化に際しての水の役割(22pEC 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 19aTC-6 1分子時系列情報に潜む状態遷移ネットワークの構成諭と可視化技術の開発(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)
• 1P060 タンパク質系の協調的運動に対するカオス時系列解析(蛋白質 C) 物生(安定性、折れたたみなど)))
• 蛋白質フォールディングのダイナミックス : 主成分空間におけるエルゴード性
• 29pZD-2 タンパク質フォールディングのダイナミックス : 溶媒の動的効果
• タンパク質フォールディングのダイナミックス : 異常拡散と階層的規則性
• 1K1715 Off-Latticeビーズモデルに基づくタンパク質ダイナミックスの時系列解析(1.蛋白質(C)物性(E)計測・解析の方法論,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
• 19aYF-3 蛋白質フォールディングにおける階層的規則性とエネルギーランドスケープ
• 一次データを保存しない大規模科学計算の可能性
• 量子chaosと散逸の起源(カオスとその周辺,研究会報告)
• 4p-PS-62, 4p-PS-63 量子カオス系による光吸収 : 量子カオスは散逸の起源でありえるか?
• 量子カオスにおける量子-古典対応回復の機構(基研長期研究会「カオスとその周辺」,研究会報告)
• 量子とカオス (カオス--複雑な系のダイナミクス)
• 46.量子カオスにおける滞在的混合性(基研長期研究会「カオスとその周辺」,研究会報告)
• 27aTH-9 生体分子と粗視化した水の動的相互作用の抽出(27aTH 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 1P065 生体分子の構造転移に伴う近傍の「水の場」の協同的運動(蛋白質 C) 物生(安定性、折れたたみなど)))
• 21pXG-6 粗視化された「水の場」を用いたポリアラニンの構造転移に伴う水の集団運動の解析(生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 28aTC-9 法双曲不変多様体の崩壊と生成、局所から大域へ(28aTC 保存力学系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 27pGV-5 生体分子の量子エネルギー移動ダイナミクス(27pGV 化学物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 28aTB-7 多変数確率過程の大域的パターンと高次相関情報量 : Connected Information(28aTB 確率過程・確率モデル(パーコレーションを含む),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 27pGT-5 詳細つり合いが成立しない遷移ネットワークから構成される有効エネルギー地形(27pGT 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 3P034 一分子時系列からの多次元自由エネルギー地形の再構築と分子記憶(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))
• 21pXG-8 生体分子の一分子時系列情報に基づ
• 「揺らぐ」世界における力学的決定性 : 化学反応系はなぜ活性化障壁を越えるのか(複雑な多谷ポテンシャルエネルギー面上で生起する動力学的諸問題-力学的決定性と統計性の中間領域を探る(第2回)-,研究会報告)
• 化学反応の「揺らぐ」世界における力学的決定性 : 70年来の「非再交差仮説」の解決
• 28aTH-3 水の場としての集団運動と生体分子の構造転移ダイナミックス(28aTH 領域12シンポジウム:水の生物物理学,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 30p-YY-14 6原子アルゴンクラスターの異性化動力学における規則性に関する研究
• 22pGS-13 法双曲不変多様体崩壊の量子力学的兆候(22pGS 保存力学系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 高次元力学系における輸送現象の理解の広がり : 法双曲不変多様体、安定多様体、不安定多様体とその崩壊(非平衡統計物理学の展望-田崎秀一さんを偲んで-)
• 領域11,領域12「化学反応や生体高分子の構造変化における状態変化の起源を探る」(第67回年次大会シンポジウムの報告,学会報告)
• 19aRD-1 化学反応の「揺らぐ」世界における力学的決定性
• 27pBJ-1 化学反応や生体高分子の構造変化における状態変化の起源を探る(27pBJ 領域12, 領域11合同シンポジウム:化学反応や生体高分子の構造変化における状態変化の起源を探る,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
• 24pAE-15 局所スペクトルを用いた大自由度力学系の解析(24pAE 保存力学系・その他の力学系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))
• 26aXL-6 法双曲的不変多様体崩壊の量子的兆候(26aXL 量子カオス系,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理))

もっと見る 閉じる

スポンサーリンク