水溶性カルボジイミドを用いるオリゴヌクレオチドの縮合反応に対する鋳型オリゴヌクレオチドの影響 : 高温下で働くことをめざしたRNA生成モデルの探索
スポンサーリンク
概要
- 論文の詳細を見る
The condensation reaction of oligonucleotides was investigated to develop a prebiotic model reaction for the formation of oligonucleotides which can be examined under hydrothermal conditions. The reaction behavior of (1) the condensation of 12-mer oligonucleotide (5'-pGGGCCCCCCGGrG, 5'-pGGGCCCGGGCCrC), (2) the condensation of oligoguanylate (5'-pGGGGGrG, 5'-pGGGGGGGrG) in the absence and presence of a oligocytidylate template, (3) the condensation of mix-hexanucleotide including guanine and cytosine (5'-pGGGCCrC, 5'-pGCGCGrC, 5'-pGCCCGrG) in the absence and presence of several 12-mer oligonucleotides, was investigated at 0 - 25℃. In these systems, it was expected that the dimerization of the starting oligonucleotides would be enhanced using 12-mer oligonucleotides or in the presence of a template oligonucleotide. However, the cyclization of oligonucleotides proceeded as the main process and the dimerization was not efficient. The rates of the cyclization of 12-mer oligonucleotides were not much different from those of hexanucleotides determined in previous studies. The rate of cyclization of 5'-pGGGGGrG or 5'-pGGGGGGGrG was somewhat affected with a oligocytidylate template. Although the cyclization of mixhexanucleotides was not much affected by the presence of 5'-GGGCCCCCCGGG or 5'-GGGCCCGGGCCC, the condensation of mix-hexanucleotides did not proceed in the presence of 5'-GCGCGCGCGCGC or 5'-GCCCGGGCCCGG. These resultes indicate that cyclization of short oligonucleotides have readily proceeded even in the presence of template oligonucleotides so that the accumulation of RNA would not be efficient through the dimerization of short oligonucleotides. Conclusively, the reactions tested in this study are not suitable for the elongation model of oligonucleotide which acts under hydrothermal conditions
- 生命の起原および進化学会の論文
- 2004-06-30
著者
-
川村 邦男
大阪府立大学工学部応用化学科
-
川村 邦男
大阪府大 大学院
-
奥田 宜子
Department Of Applied Chemistry Graduate School Of Engineering Osaka Prefecture University
-
川村 邦男
大阪府立大学大学院工学研究科
-
岡本 文敬
大阪府立大学大学院工学研究科応用化学分野
-
奥田 宜子
大阪府立大学大学院工学研究科応用化学分野
-
岡本 文敬
Department of Applied Chemistry, Graduate School of Engineering, Osaka Prefecture University
-
岡本 文敬
Department Of Applied Chemistry Graduate School Of Engineering Osaka Prefecture University
関連論文
- 前生物的化学に基づいてRNAワールド仮説を検証する(シンポジウム「生命起原研究を巡って」)
- S1-3 前生物的化学に基づいてRNAワールド仮説を検証する(生命起原研究を巡って,シンポジウム1,第34回学術講演会講演要旨集)
- S2-4 熱水分析技術の開発と化学進化研究への展開(海底熱水系と生命の起原,シンポジウム2,第35回学術講演会講演要旨集)
- 元気のでる起源研究
- Session 4 : From Molecules to Life-Like Systems & RNA World("分子から生命システムへ"および"RNAワールド")(ISOLAB'05シンポジウムオーガナイザーによる解説)
- 中温水中におけるRNAポリマーの加水分解反応の速度論 : RNAとリボヌクレアーゼの化学進化に関する考察
- 中温水中におけるポリヌクレオチド類の加水分解反応挙動
- 高温水溶液中におけるアデノシン5′-三リン酸の加水分解反応の速度論的研究:RNAの化学進化における考察
- 高温水溶液中における核酸の分解および生成反応の速度論的研究
- 3P259 生命の熱水起原を検証するためのin situ紫外可視吸光光度法(生命の起源・進化)
- RNAモノマーとRNAポリメラーゼの化学進化:アミノ酸熱重合物を原始酵素として用いるヌクレオシド5'-三リン酸からのRNAの非生物的生成経路の探索に基づく推測
- 1P162生命の主体性からみる生命の起原(3) : 生命の起原におけるシステムの主体性の重要性について
- RNAワールド仮説を生命の熱水起原説から検証する:生命の起原のシナリオの再構築-
- 生命の起源を核酸化学から探る-最初の遺伝子はどのように生まれたか
- RNAワールド仮説を生命の熱水起原説から検証する -化学進化シナリオの再構築-
- 水熱反応の高速追跡法を用いる種々の2',5'-及び3',5'-ジヌクレオシドモノリン酸の加水分解反応速度論
- 高温水溶液中におけるRNAの化学進化過程の解析 : 水熱反応の新しい高速追跡法の開発
- 流通式反応器を用いる水熱反応の速度論的解析-398-573Kにおけるアデノシン5'-三リン酸の加水分解反応-
- ボリシチジル酸を鋳型とするオリゴグアニル酸生成反応の中温水中における速度論的解析
- 水熱反応の速度論的解析:流通式反応器を用いるATPの加水分解反応速度の測定
- RNAの人工分子進化法
- モンモリロナイト上におけるアデノシン,ウリジン,およびイノシン-5′リン酸イミダゾリドの重合反応の速度論的研究
- モンモリロナイト上におけるヌクレオシド-5'-リン酸イミダゾリド重合反応の速度論的研究
- 10 熱水環境下における2〜5鎖長オリゴアラニンの反応挙動と効果的伸長経路の発見(一般講演,第31回学術講演会講演要旨集)
- 生命の起源を核酸化学から探る : 最初の遺伝子はどのように生まれたか(生命の起源を化学から探る)
- 生命起源の解明をめざした熱水フローリアクターシステムの開発
- 熱水フローリアクターの技術開発と化学進化研究への適用 : 生命的システムの実験的検証のための第2段階(2010年学術講演会におけるシンポジウム「海底熱水系と生命の起原」)
- オリゴグアニル酸の鋳型指示生成反応に対する生体アミノ酸の影響
- RNAワールド以前と以後 : 実験および理論による推定(ISOLAB '05プロシーディング)
- 分子進化工学によって創製されるアプタマーを用いたセンサー
- 生命の起源雑感 : 酵素の起源について
- 生命の主体性に基づく生命系の時間発展の理論 : 化学進化, 生物進化, 文化・文明の発展を生命現象としてみる
- Workshop : "Alternative Evolutionary Theories in the 20th and 21st Centuries in the International and Interdisciplinary Perspective, Herzen State Pedagogical University of Russia, St. Petersburg, June 3-4, 2004.
- 水溶性カルボジイミドを用いるオリゴヌクレオチドの縮合反応に対する鋳型オリゴヌクレオチドの影響 : 高温下で働くことをめざしたRNA生成モデルの探索
- グアニンおよびシトシンを含むヘキサヌクレオチドの水溶性カルボジイミドによる環化反応の0〜75℃における温度依存性
- 水熱反応の高速追跡法を用いる250-290℃におけるオリゴアラニンの環化反応挙動の解析
- 熱水中における核酸およびタンパク質の化学進化 : 分解速度と生成速度の比較
- グアニンおよびシトシンを含むヘキサヌクレオチドの水溶性カルボジイミドによる環化および二量化反応
- 中温水中におけるヘキサヌクレオチドの非酵素的リン酸ジエステル結合生成反応の測定
- 鋳型指示オリゴグアニル酸生成反応に対する種々のアミノ酸熱重合物の影響
- 水熱反応の高速追跡法を用いる225〜275℃におけるアラニンのラセミ化速度の測定
- 生命の主体性からみる生命の起原(2)-情報と機能の対応付け,主体性の定義,および生命の起原について-
- 生命の主体性からみる生命の起原(1)-生命の定義,および進化における主体性の再考-
- 前生物的RNA複製反応に対するタンパク質状物質の原始酵素機能の探索
- Workshop on Life(イタリア,モデナ市)に参加して
- グアニン及びシトシンを含むオリゴヌクレオチドの塩基配列依存型重合反応の探索
- 14 鉱物充填熱水フローリアクターの開発とオリゴペプチド生成反応に対する鉱物の効果(一般講演,第37回学術講演会講演要旨集)